RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516552.1

RNU6-118P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 118, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-118P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-118P-201ENST00000516552 SMRP1Q8NCR6 262 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF592Q92610 1267 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 TRERF1Q96PN7 1200 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 TMEM209Q96SK2 561 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PIGQQ9BRB3 760 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 SENP2Q9HC62 589 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF446Q9NWS9 450 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 RNF112Q9ULX5 631 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 TRPC6Q9Y210 931 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ASTN1O14525 1302 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 LTBP3Q9NS15 1303 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 MASP2O00187 686 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 KCNQ2O43526 872 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 C8BP07358 591 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 CSF2RBP32927 897 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 KLK7P49862 253 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 RAG2P55895 527 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PRR20EP86478 221 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PRR20CP86479 221 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PRR20DP86480 221 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PRR20BP86481 221 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PRR20AP86496 221 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 EBI3Q14213 229 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 SPCS2Q15005 226 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 VWA2Q5GFL6 755 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 HMBOX1Q6NT76 420 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 Q6ZS52 159 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 Q6ZTC4 211 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 KSR1Q8IVT5 923 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 LGI3Q8N145 548 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 DBF4BQ8NFT6 615 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 NTNG2Q96CW9 530 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADAM33Q9BZ11 813 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PRDM8Q9NQV8 689 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 RTEL1Q9NZ71 1219 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXJ2Q9P0K8 574 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ARMCX1Q9P291 453 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 RABGEF1Q9UJ41 708 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 NAGPAQ9UK23 515 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 NTNG1Q9Y2I2 539 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 LMTK3Q96Q04 1460 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 CENPEQ02224 2701 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 AXIN1O15169 862 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 HRO43593 1189 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 NOBOXO60393 691 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PPP1R37O75864 691 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 HKR1P10072 659 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 FSTP19883 344 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PTPN5P54829 565 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ASPHD2Q6ICH7 369 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PODNQ7Z5L7 613 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 RADILQ96JH8 1075 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ADAMTS10Q9H324 1103 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 PARD6AQ9NPB6 346 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ZFP57Q9NU63 452 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 LRP12Q9Y561 859 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 HRH3Q9Y5N1 445 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 MED13Q9UHV7 2174 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 KMT2EQ8IZD2 1858 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 F8P00451 2351 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 CADP27708 2225 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 C9orf172C9J069 976 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 ATP9BO43861 1147 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-118P-201ENST00000516552 TADA3O75528 432 aa-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms