RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 ADM5C9JUS6 153 aa23.42■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 RIMBP2O15034 1052 aa23.42■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.42■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 ECE2O60344 883 aa23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 RGMBQ6NW40 437 aa23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF853P0CG23 659 aa23.4■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 DOK7Q18PE1 504 aa23.4■■□□□ 1.34
ITGA3-215ENST00000515147 C6orf229H3BNL8 230 aa23.39■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.38■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 APAF1O14727 1248 aa23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.37■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.36■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.36■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC102AQ96A19 550 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 EYA3Q99504 573 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 IFT57Q9NWB7 429 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 RNF186Q9NXI6 227 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 GGA3Q9NZ52 723 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 GNAI1P63096 354 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 GOLGA2Q08379 1002 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF609O15014 1411 aa23.33■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 SLC10A3P09131 477 aa23.33■■□□□ 1.33
ITGA3-215ENST00000515147 TRPA1O75762 1119 aa23.32■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 CSRNP1Q96S65 589 aa23.32■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 MYD88Q99836 296 aa23.32■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 CDCA5Q96FF9 252 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 SULF1Q8IWU6 871 aa23.3■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.3■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 SPEF2Q9C093 1822 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 UFL1O94874 794 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.28■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 GMLQ99445 158 aa23.28■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 PDE8AO60658 829 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 SOX10P56693 466 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 SCARF1Q14162 830 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 GGA1Q9UJY5 639 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 MYH3P11055 1940 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.26■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.26■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 TSPYL6Q8N831 410 aa23.25■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 G3V3G9 751 aa23.23■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.23■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 MOB2Q70IA6 237 aa23.23■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.23■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.23■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.22■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.22■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 FKBP1BP68106 108 aa23.21■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.21■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 XDHP47989 1333 aa23.21■■□□□ 1.31
ITGA3-215ENST00000515147 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 IGKV5-2P06315 115 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L8P0C7I0 530 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 KSR2Q6VAB6 950 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L3A6NCW0 530 aa23.19■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L4A6NCW7 530 aa23.19■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms