RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514232.1

SMARCAD1-208, Transcript of SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1, human

TSL 3

Gene SMARCAD1, Length 444 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IER5	Q5VY09	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CYP26A1	O43174	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ADAM11	O75078	769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232		J3QW42	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	KRT1	P04264	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SPRED2	Q7Z698	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	BCAN	Q96GW7	911 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RARA	P10276	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	HOXA5	P20719	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SIK1	P57059	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	GGN	Q86UU5	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SKI	P12755	728 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	INPP5B	P32019	993 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ADM	P35318	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	HIF1A	Q16665	826 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RELT	Q969Z4	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SASH3	O75995	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	GATA6	Q92908	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RTN1	Q16799	776 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FUT4	P22083	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	GTF2I	P78347	998 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FSCN2	O14926	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	GHRH	P01286	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	EPB42	P16452	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	MLANA	Q16655	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	C21orf2	O43822	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	NFKB2	Q00653	900 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SMARCAD1-208	ENST00000514232	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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