RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512427.5

HOXC-AS1-202, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene HOXC-AS1, Length 290 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GPSM2P81274 684 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RALBP1Q15311 655 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZIC5Q96T25 663 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLLQ9UGP5 575 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UFL1O94874 794 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 VIL1P09327 827 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FKBP1BP68106 108 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NEUROD2Q15784 382 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DOK7Q18PE1 504 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AGBL3Q8NEM8 1001 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TBC1D16Q8TBP0 767 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RNF186Q9NXI6 227 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GGA1Q9UJY5 639 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXC-AS1-202ENST00000512427 EGFRP00533 1210 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GOLGA2Q08379 1002 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDCA5Q96FF9 252 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RTL9Q8NET4 1388 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF609O15014 1411 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TAF1P21675 1872 aa12.02□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 AKAP11Q9UKA4 1901 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CSRNP1Q96S65 589 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SOX10P56693 466 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCARF1Q14162 830 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KRT24Q2M2I5 525 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DLK2Q6UY11 383 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RASAL3Q86YV0 1011 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF428Q96B54 188 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 RUNDC1Q96C34 613 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 KCNQ5Q9NR82 932 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HDAC9Q9UKV0 1011 aa12□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDE8AO60658 829 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP17L8P0C7I0 530 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NF2P35240 595 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PODNQ7Z5L7 613 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 XDHP47989 1333 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP17L3A6NCW0 530 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP17L4A6NCW7 530 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ATP2B4P23634 1241 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 OGFOD1Q8N543 542 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MMP14P50281 582 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SREBF2Q12772 1141 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MYD88Q99836 296 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GMLQ99445 158 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MBIPQ9NS73 344 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 SCN9AQ15858 1988 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 MED23Q9ULK4 1368 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 GNAI1P63096 354 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 PSME4Q14997 1843 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 TM4SF4P48230 202 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CTSWP56202 376 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HOXC-AS1-202ENST00000512427 FBXW7Q969H0 707 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms