RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS33BQ9H267 617 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 CXCL9Q07325 125 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 WASHC4Q2M389 1173 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-218ENST00000511185 RAD17O75943 681 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 FSTL1Q12841 308 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SUCLG2Q96I99 432 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 HACL1Q9UJ83 578 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 XDHP47989 1333 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 EPHX2P34913 555 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 HTRA3P83110 453 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KAZALD1Q96I82 304 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GGA1Q9UJY5 639 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ECE2O60344 883 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 DOK7Q18PE1 504 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 UTYO14607 1347 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 EPS15P42566 896 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 SHTN1A0MZ66 631 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 EYA3Q99504 573 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 KLRK1P26718 216 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 MED23Q9ULK4 1368 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CHADLQ6NUI6 762 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 PSMD14O00487 310 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 LDHDQ86WU2 507 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TNNQ9UQP3 1299 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 APLP1P51693 650 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNDQ07001 517 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 SNAP23O00161 211 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP2B4P23634 1241 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 USP44Q9H0E7 712 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 BCAR3O75815 825 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF16BQ96L93 1317 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF5LO75529 589 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TNIP1Q15025 636 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PASKQ96RG2 1323 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 MICALL2Q8IY33 904 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF609O15014 1411 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 EGFRP00533 1210 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM27P14373 513 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 G3V3G9 751 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-218ENST00000511185 MEIS3Q99687 375 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms