RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 RLBP1P12271 317 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.87■■□□□ 1.25
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SH3BP2-214ENST00000509677 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 GPSM2P81274 684 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP2-214ENST00000509677 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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SH3BP2-214ENST00000509677 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.85■■□□□ 1.25
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SH3BP2-214ENST00000509677 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
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SH3BP2-214ENST00000509677 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-214ENST00000509677 PPIP5K2O43314 1243 aa22.82■■□□□ 1.24
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SH3BP2-214ENST00000509677 POLLQ9UGP5 575 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 GGA1Q9UJY5 639 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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SH3BP2-214ENST00000509677 JDP2Q8WYK2 163 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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SH3BP2-214ENST00000509677 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.79■■□□□ 1.24
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SH3BP2-214ENST00000509677 WASHC4Q2M389 1173 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 SCN4AP35499 1836 aa22.78■■□□□ 1.24
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SH3BP2-214ENST00000509677 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 EYA3Q99504 573 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 VPS33BQ9H267 617 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-214ENST00000509677 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.76■■□□□ 1.23
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SH3BP2-214ENST00000509677 COL4A5P29400 1685 aa22.74■■□□□ 1.23
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SH3BP2-214ENST00000509677 TAF5LO75529 589 aa22.74■■□□□ 1.23
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SH3BP2-214ENST00000509677 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.74■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.74■■□□□ 1.23
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SH3BP2-214ENST00000509677 LRRC24Q50LG9 513 aa22.73■■□□□ 1.23
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SH3BP2-214ENST00000509677 SPEF2Q9C093 1822 aa22.73■■□□□ 1.23
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SH3BP2-214ENST00000509677 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 G3V3G9 751 aa22.71■■□□□ 1.23
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SH3BP2-214ENST00000509677 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 SIL1Q9H173 461 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 LTBP1Q14766 1721 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-214ENST00000509677 METTL24Q5JXM2 366 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-214ENST00000509677 CHADLQ6NUI6 762 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-214ENST00000509677 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-214ENST00000509677 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-214ENST00000509677 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-214ENST00000509677 EYA2O00167 538 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-214ENST00000509677 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-214ENST00000509677 MTX1Q13505 466 aa22.69■■□□□ 1.22
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