RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 WASHC4Q2M389 1173 aa21.49■■□□□ 1.03
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AGRN-209ENST00000492947 CLEC11AQ9Y240 323 aa21.49■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 SLFN5Q08AF3 891 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 GCKRQ14397 625 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 CNTNAP1P78357 1384 aa21.48■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.47■■□□□ 1.03
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AGRN-209ENST00000492947 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.47■■□□□ 1.03
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AGRN-209ENST00000492947 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
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AGRN-209ENST00000492947 MIER1Q8N108 512 aa21.46■■□□□ 1.03
AGRN-209ENST00000492947 GREM2Q9H772 168 aa21.46■■□□□ 1.03
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AGRN-209ENST00000492947 DOK7Q18PE1 504 aa21.43■■□□□ 1.02
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AGRN-209ENST00000492947 EYA3Q99504 573 aa21.43■■□□□ 1.02
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AGRN-209ENST00000492947 F6X3S4 739 aa21.41■■□□□ 1.02
AGRN-209ENST00000492947 TRAF5O00463 557 aa21.41■■□□□ 1.02
AGRN-209ENST00000492947 UFL1O94874 794 aa21.41■■□□□ 1.02
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AGRN-209ENST00000492947 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.38■■□□□ 1.01
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AGRN-209ENST00000492947 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
AGRN-209ENST00000492947 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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AGRN-209ENST00000492947 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.33■■□□□ 1
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