RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRN-216ENST00000486480 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRN-216ENST00000486480 XDHP47989 1333 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPRN-216ENST00000486480 GNAI3P08754 354 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 POLLQ9UGP5 575 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 C6orf229H3BNL8 230 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 JDP2Q8WYK2 163 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 UFL1O94874 794 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 GGA1Q9UJY5 639 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 NIM1KQ8IY84 436 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 WDR90Q96KV7 1748 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 GLTPD2A6NH11 291 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 FZD9O00144 591 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 MS4A1P11836 297 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 PANK1Q8TE04 598 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 EYA3Q99504 573 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 PLIN1O60240 522 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 ATP2B4P23634 1241 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 CHRNDQ07001 517 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 WASHC4Q2M389 1173 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN-216ENST00000486480 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 RIMBP2O15034 1052 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 SCN9AQ15858 1988 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 GNAI2P04899 355 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 PSME4Q14997 1843 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 MED23Q9ULK4 1368 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 SCN4AP35499 1836 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 TAF5LO75529 589 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 MTX1Q13505 466 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRN-216ENST00000486480 YDJCA8MPS7 323 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 KCNJ4P48050 445 aa23.89■■□□□ 1.41
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PTPRN-216ENST00000486480 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 LRRC24Q50LG9 513 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 GPC2Q8N158 579 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 KIF3CO14782 793 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 ECE2O60344 883 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 PDE3AQ14432 1141 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 DOK7Q18PE1 504 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 RRAGCQ9HB90 399 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 COG6Q9Y2V7 657 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 SNAP23O00161 211 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 SRGAP3O43295 1099 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 KLRK1P26718 216 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 CXCL9Q07325 125 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 G3V3G9 751 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 EYA2O00167 538 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 METTL24Q5JXM2 366 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 POTECB2RU33 542 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 RAD17O75943 681 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 COPRSQ9NQ92 184 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 CIAO1O76071 339 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 SIL1Q9H173 461 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO3Q9UK99 471 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.83■■□□□ 1.41
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