RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 GOLGA2Q08379 1002 aa30.16■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 DOK7Q18PE1 504 aa30.16■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC191Q8NCU4 936 aa30.16■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 VIL1P09327 827 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 EYA3Q99504 573 aa30.15■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 MYD88Q99836 296 aa30.15■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 BEGAINQ9BUH8 593 aa30.14■■■□□ 2.42
NBPF3-211ENST00000485941 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 ZIC5Q96T25 663 aa30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 TSKSQ9UJT2 592 aa30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF609O15014 1411 aa30.13■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 PDE8AO60658 829 aa30.11■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 CA12O43570 354 aa30.1■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 TSPYL6Q8N831 410 aa30.1■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.09■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.09■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
NBPF3-211ENST00000485941 ADM5C9JUS6 153 aa30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 UFL1O94874 794 aa30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 IGKV5-2P06315 115 aa30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 HUNKP57058 714 aa30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 GMLQ99445 158 aa30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 GGA1Q9UJY5 639 aa30.07■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 NOGQ13253 232 aa30.06■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.06■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa30.05■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.05■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.05■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 PSME4Q14997 1843 aa30.04■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 RGMBQ6NW40 437 aa30.03■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 KSR2Q6VAB6 950 aa30.03■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.03■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 XDHP47989 1333 aa30.02■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC184Q52MB2 194 aa30.02■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.02■■■□□ 2.4
NBPF3-211ENST00000485941 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.01■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa30.01■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.01■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.01■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 GGA3Q9NZ52 723 aa30.01■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 RGS19P49795 217 aa30■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CTSWP56202 376 aa30■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa30■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 ATP2B4P23634 1241 aa29.99■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC27Q2M243 656 aa29.99■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 C2orf69Q8N8R5 385 aa29.99■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 PODNQ7Z5L7 613 aa29.98■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 MINPP1Q9UNW1 487 aa29.98■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 SCARF1Q14162 830 aa29.97■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 G2E3Q7L622 706 aa29.97■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.97■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 GREM2Q9H772 168 aa29.97■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 H7C1W4 665 aa29.96■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 SULF1Q8IWU6 871 aa29.96■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC102AQ96A19 550 aa29.96■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CDCA5Q96FF9 252 aa29.96■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 NEURL1BA8MQ27 555 aa29.95■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 WWC1Q8IX03 1113 aa29.95■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
NBPF3-211ENST00000485941 MED23Q9ULK4 1368 aa29.94■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 USP17L3A6NCW0 530 aa29.94■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 USP17L4A6NCW7 530 aa29.94■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 SLC10A3P09131 477 aa29.94■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.94■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.94■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 G3V3G9 751 aa29.93■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 USP17L8P0C7I0 530 aa29.93■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.93■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.93■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa29.93■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC85CA6NKD9 419 aa29.92■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 CASP7P55210 303 aa29.92■■■□□ 2.38
NBPF3-211ENST00000485941 FAM161AQ3B820 660 aa29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms