RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 MAP2K2P36507 400 aa28.51■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.49■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 G3V3G9 751 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 DOK7Q18PE1 504 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 GGA1Q9UJY5 639 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 SHTN1A0MZ66 631 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 UFL1O94874 794 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 STK31Q9BXU1 1019 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC27Q2M243 656 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 KSR2Q6VAB6 950 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRN-215ENST00000484986 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 USP48Q86UV5 1035 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 VIL1P09327 827 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 TSPYL6Q8N831 410 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 RTL9Q8NET4 1388 aa28.44■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 COL4A1P02462 1669 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 CA12O43570 354 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 XDHP47989 1333 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 AOC2O75106 756 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 CTSWP56202 376 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 WWC1Q8IX03 1113 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 EGFRP00533 1210 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 IGKV5-2P06315 115 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 ATP2B4P23634 1241 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PTPRN-215ENST00000484986 IL16Q14005 1332 aa28.39■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 HUNKP57058 714 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 NOGQ13253 232 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.37■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF609O15014 1411 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 PODNQ7Z5L7 613 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 SULF1Q8IWU6 871 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 SLC4A2P04920 1241 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC184Q52MB2 194 aa28.35■■■□□ 2.13
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PTPRN-215ENST00000484986 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 ABHD8Q96I13 439 aa28.34■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 ADM5C9JUS6 153 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 GREM2Q9H772 168 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 GGA3Q9NZ52 723 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRN-215ENST00000484986 USP17L3A6NCW0 530 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 USP17L4A6NCW7 530 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 RGMBQ6NW40 437 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 H7C1W4 665 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 USP17L8P0C7I0 530 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 DLK2Q6UY11 383 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC102AQ96A19 550 aa28.31■■■□□ 2.12
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PTPRN-215ENST00000484986 G2E3Q7L622 706 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.3■■■□□ 2.12
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PTPRN-215ENST00000484986 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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PTPRN-215ENST00000484986 SCARF1Q14162 830 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 GMLQ99445 158 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 MRS2Q9HD23 443 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 SCN9AQ15858 1988 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 GCKRQ14397 625 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRN-215ENST00000484986 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
PTPRN-215ENST00000484986 WDR63Q8IWG1 891 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRN-215ENST00000484986 LINS1Q8NG48 757 aa28.26■■■□□ 2.11
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