RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	UFL1	O94874	794 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	EYA3	Q99504	573 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	DOK7	Q18PE1	504 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	FAM161A	Q3B820	660 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	GGA1	Q9UJY5	639 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	ECE2	O60344	883 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	TNIP1	Q15025	636 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	XDH	P47989	1333 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	CSF1R	P07333	972 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	CNTROB	Q8N137	903 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PSME4-208	ENST00000481518	SHTN1	A0MZ66	631 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	PSMD14	O00487	310 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	ITGA6	P23229	1130 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	CREBZF	Q9NS37	354 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	SCN9A	Q15858	1988 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	FOXO4	P98177	505 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	JMY	Q8N9B5	988 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	GRM8	O00222	908 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	ATP2B4	P23634	1241 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	ALDH1L1	O75891	902 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSME4-208	ENST00000481518	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	29.2	■■■□□ 2.26	6e-7	■□□□□ 9.7
PSME4-208	ENST00000481518	MICALL2	Q8IY33	904 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	MED23	Q9ULK4	1368 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	DPF2	Q92785	391 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518		G3V3G9	751 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	PSME4	Q14997	1843 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	PTPRC	P08575	1304 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	TRAF5	O00463	557 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	MIER1	Q8N108	512 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518		H7C1D1	291 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	EGFR	P00533	1210 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	KAZALD1	Q96I82	304 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	CNTNAP1	P78357	1384 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518		A0A1B0GUL6	1792 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	KLRK1	P26718	216 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	SUCLG2	Q96I99	432 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSME4-208	ENST00000481518	CHRND	Q07001	517 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	UTY	O14607	1347 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF609	O15014	1411 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	PODN	Q7Z5L7	613 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	SNAP23	O00161	211 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	CST9	Q5W186	159 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	GML	Q99445	158 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L3	A6NCW0	530 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	USP17L4	A6NCW7	530 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	TAF5L	O75529	589 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PSME4-208	ENST00000481518	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms