RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	MPND	Q8N594	471 aa		30.35	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		30.35	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		30.35	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		30.34	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	NFKBIE	O00221	500 aa		30.34	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	PSMD1	Q99460	953 aa		30.34	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	30.34	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		30.34	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	30.34	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		30.34	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	GPSM2	P81274	684 aa		30.33	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		30.33	■■■□□ 2.45
KCNS3-205	ENST00000481414	EYA2	O00167	538 aa		30.32	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	30.32	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	30.32	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		30.32	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	30.32	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		30.32	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	XDH	P47989	1333 aa		30.31	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	CIAO1	O76071	339 aa		30.31	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	CHRND	Q07001	517 aa		30.31	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	LRRC24	Q50LG9	513 aa		30.31	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		30.31	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	30.31	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		30.31	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		30.3	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		30.29	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	HMMR	O75330	724 aa		30.29	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		30.29	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	SPEF2	Q9C093	1822 aa		30.29	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	30.28	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		30.28	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	SIL1	Q9H173	461 aa		30.28	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	UTRN	P46939	3433 aa		30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	ATP2B4	P23634	1241 aa		30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	RASSF7	Q02833	373 aa		30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	POLL	Q9UGP5	575 aa		30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	GGA1	Q9UJY5	639 aa		30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		30.27	■■■□□ 2.44
KCNS3-205	ENST00000481414	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		30.26	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	VPS33B	Q9H267	617 aa		30.26	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	30.26	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	LTBP1	Q14766	1721 aa		30.25	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	UFL1	O94874	794 aa		30.24	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	LMNB1	P20700	586 aa		30.24	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	30.24	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	METTL24	Q5JXM2	366 aa		30.24	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	30.24	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		30.24	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	C6orf229	H3BNL8	230 aa		30.23	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	TAF5L	O75529	589 aa		30.23	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	30.23	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	PRELP	P51888	382 aa		30.23	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		30.23	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	30.23	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	EYA3	Q99504	573 aa		30.22	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		30.22	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	PDE8B	O95263	885 aa		30.21	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	30.21	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		30.21	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	UBE4A	Q14139	1066 aa		30.2	■■■□□ 2.43
KCNS3-205	ENST00000481414	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	30.19	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNJ4	P48050	445 aa		30.19	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		30.19	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	WASHC4	Q2M389	1173 aa		30.19	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		30.18	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	PPIP5K2	O43314	1243 aa		30.17	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		30.17	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	MED23	Q9ULK4	1368 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	SNAP23	O00161	211 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	SASH1	O94885	1247 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	AOC3	Q16853	763 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	RNF181	Q9P0P0	153 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	SBF1	O95248	1867 aa		30.16	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A1B0GUL6	1792 aa		30.15	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	FGFR2	P21802	821 aa		30.15	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		30.15	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	RIMBP2	O15034	1052 aa		30.14	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	TFCP2	Q12800	502 aa		30.14	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	DCTPP1	Q9H773	170 aa		30.14	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		30.14	■■■□□ 2.42
KCNS3-205	ENST00000481414	JDP2	Q8WYK2	163 aa		30.13	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	LPIN2	Q92539	896 aa		30.13	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		30.13	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	RAB11FIP3	O75154	756 aa		30.12	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	NEFL	P07196	543 aa		30.12	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	KLRK1	P26718	216 aa		30.11	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		30.11	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	GPR108	Q9NPR9	543 aa		30.11	■■■□□ 2.41
KCNS3-205	ENST00000481414	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	30.1	■■■□□ 2.41

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