RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 POLLQ9UGP5 575 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 BCAR3O75815 825 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 TOMM70O94826 608 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 UFL1O94874 794 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 GPC2Q8N158 579 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 GGA1Q9UJY5 639 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 PSME4Q14997 1843 aa26.2■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 RIMBP2O15034 1052 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 KAZALD1Q96I82 304 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 USP44Q9H0E7 712 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.19■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 SCN9AQ15858 1988 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 POTECB2RU33 542 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.17■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 ATP2B4P23634 1241 aa26.16■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 TRIM27P14373 513 aa26.15■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.15■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.14■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.14■■□□□ 1.78
NELFE-208ENST00000481121 CXCL9Q07325 125 aa26.14■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 YDJCA8MPS7 323 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 ECE2O60344 883 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 HACL1Q9UJ83 578 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 MED23Q9ULK4 1368 aa26.13■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 G3V3G9 751 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 CHRNDQ07001 517 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.12■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 RAD17O75943 681 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 DOK7Q18PE1 504 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.11■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 TNIP1Q15025 636 aa26.1■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.1■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 TNNQ9UQP3 1299 aa26.1■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.1■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 SCNN1DP51172 638 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 EPHX2P34913 555 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 KCNJ4P48050 445 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 FSTL1Q12841 308 aa26.09■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 MEIS3Q99687 375 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.08■■□□□ 1.77
NELFE-208ENST00000481121 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 TAF5LO75529 589 aa26.05■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 PSMD14O00487 310 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 GNAI3P08754 354 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 POTEIP0CG38 1075 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 POTEJP0CG39 1038 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 CEP350Q5VT06 3117 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 HSPA6P17066 643 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 LDHDQ86WU2 507 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 KLRK1P26718 216 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 EPS15P42566 896 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 PLIN1O60240 522 aa26.02■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 CHADLQ6NUI6 762 aa26.02■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 PODNQ7Z5L7 613 aa26.02■■□□□ 1.76
NELFE-208ENST00000481121 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 COA1Q9GZY4 146 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 SNAP23O00161 211 aa26■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NELFE-208ENST00000481121 CLEC11AQ9Y240 323 aa26■■□□□ 1.75
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