RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 EYA3Q99504 573 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 DBNDD1Q9H9R9 158 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 GPRC5DQ9NZD1 345 aa30.48■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa30.47■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 UFL1O94874 794 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 TNIP1Q15025 636 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 KLRG1Q96E93 195 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 GGA1Q9UJY5 639 aa30.46■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 FAM161AQ3B820 660 aa30.45■■■□□ 2.47
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PTPRD-210ENST00000481079 CLEC11AQ9Y240 323 aa30.45■■■□□ 2.47
PTPRD-210ENST00000481079 XDHP47989 1333 aa30.45■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 ECE2O60344 883 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 FOXO4P98177 505 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 DOK7Q18PE1 504 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 KCNQ5Q9NR82 932 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 SCN9AQ15858 1988 aa30.44■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
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PTPRD-210ENST00000481079 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.43■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
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PTPRD-210ENST00000481079 CNTROBQ8N137 903 aa30.41■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 EPHA10Q5JZY3 1008 aa30.4■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.4■■■□□ 2.46
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PTPRD-210ENST00000481079 CREBZFQ9NS37 354 aa30.4■■■□□ 2.46
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PTPRD-210ENST00000481079 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.39■■■□□ 2.46
PTPRD-210ENST00000481079 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
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PTPRD-210ENST00000481079 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 JMYQ8N9B5 988 aa30.38■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 PTPRCP08575 1304 aa30.38■■■□□ 2.45
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PTPRD-210ENST00000481079 DPF2Q92785 391 aa30.36■■■□□ 2.45
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PTPRD-210ENST00000481079 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 MED23Q9ULK4 1368 aa30.35■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 UTYO14607 1347 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.34■■■□□ 2.45
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PTPRD-210ENST00000481079 MICALL2Q8IY33 904 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 TRPM4Q8TD43 1214 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 KAZALD1Q96I82 304 aa30.34■■■□□ 2.45
PTPRD-210ENST00000481079 PGAP2Q9UHJ9 254 aa30.34■■■□□ 2.45
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PTPRD-210ENST00000481079 A0A1B0GUL6 1792 aa30.33■■■□□ 2.45
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PTPRD-210ENST00000481079 TMEM88BA6NKF7 163 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
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PTPRD-210ENST00000481079 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.31■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 H7C1D1 291 aa30.3■■■□□ 2.44
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PTPRD-210ENST00000481079 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.3■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 G3V3G9 751 aa30.29■■■□□ 2.44
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PTPRD-210ENST00000481079 PODNQ7Z5L7 613 aa30.29■■■□□ 2.44
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PTPRD-210ENST00000481079 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.29■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.28■■■□□ 2.44
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PTPRD-210ENST00000481079 CNTNAP1P78357 1384 aa30.27■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 IRS2Q9Y4H2 1338 aa30.26■■■□□ 2.44
PTPRD-210ENST00000481079 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 TRPM7Q96QT4 1865 aa30.25■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 CCDC57Q2TAC2 916 aa30.25■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 GMLQ99445 158 aa30.25■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 SNAP23O00161 211 aa30.24■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 AGBL3Q8NEM8 1001 aa30.24■■■□□ 2.43
PTPRD-210ENST00000481079 USP44Q9H0E7 712 aa30.24■■■□□ 2.43
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