RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 GGA1Q9UJY5 639 aa29.79■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 JMYQ8N9B5 988 aa29.78■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 RAD17O75943 681 aa29.77■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa29.77■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 MINPP1Q9UNW1 487 aa29.77■■■□□ 2.36
C9orf3-215ENST00000478473 UFL1O94874 794 aa29.76■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 ATP2B4P23634 1241 aa29.76■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 DPF2Q92785 391 aa29.76■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.76■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 CREBZFQ9NS37 354 aa29.76■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 PTPRCP08575 1304 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 GRM8O00222 908 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 RIMBP2O15034 1052 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 FOXO4P98177 505 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 DBNDD1Q9H9R9 158 aa29.75■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 ECE2O60344 883 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 ITGA6P23229 1130 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 CNTROBQ8N137 903 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.74■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF609O15014 1411 aa29.73■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 FAM161AQ3B820 660 aa29.73■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 SSH1Q8WYL5 1049 aa29.73■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 RPS12P25398 132 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.72■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 UTYO14607 1347 aa29.71■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 PSMD14O00487 310 aa29.71■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 DOK7Q18PE1 504 aa29.71■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 MED23Q9ULK4 1368 aa29.7■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 BCL2L13Q9BXK5 485 aa29.7■■■□□ 2.35
C9orf3-215ENST00000478473 VIL1P09327 827 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.69■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.69■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 SCN9AQ15858 1988 aa29.68■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 PODNQ7Z5L7 613 aa29.68■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.67■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.66■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 MPHOSPH8Q99549 860 aa29.66■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 H7C1D1 291 aa29.65■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 KAZALD1Q96I82 304 aa29.65■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 PSME4Q14997 1843 aa29.65■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 SPEF2Q9C093 1822 aa29.65■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.64■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 MICALL2Q8IY33 904 aa29.64■■■□□ 2.34
C9orf3-215ENST00000478473 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.62■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.62■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 GMLQ99445 158 aa29.62■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 PCNTO95613 3336 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 SHTN1A0MZ66 631 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 G3V3G9 751 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 CHRNDQ07001 517 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 MIER1Q8N108 512 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 CNTNAP1P78357 1384 aa29.61■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 SUCLG2Q96I99 432 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 COA1Q9GZY4 146 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 IRS2Q9Y4H2 1338 aa29.6■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.59■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 USP17L3A6NCW0 530 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 USP17L4A6NCW7 530 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.58■■■□□ 2.33
C9orf3-215ENST00000478473 RASSF10A6NK89 507 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf3-215ENST00000478473 USP44Q9H0E7 712 aa29.57■■■□□ 2.32
C9orf3-215ENST00000478473 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.56■■■□□ 2.32
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
C9orf3-215ENST00000478473 A0A1B0GUL6 1792 aa29.55■■■□□ 2.32
C9orf3-215ENST00000478473 EGFRP00533 1210 aa29.55■■■□□ 2.32
C9orf3-215ENST00000478473 CST9Q5W186 159 aa29.55■■■□□ 2.32
C9orf3-215ENST00000478473 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms