RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478272.1

TMTC4-208, Transcript of transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, human

TSL 2

Gene TMTC4, Length 798 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMTC4-208	ENST00000478272	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	PLIN1	O60240	522 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	FOXO4	P98177	505 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.69	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	TOMM70	O94826	608 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	MEIS3	Q99687	375 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	COL4A5	P29400	1685 aa		11.68	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.67	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	KIF3C	O14782	793 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	CSF1R	P07333	972 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	ITGA6	P23229	1130 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.66	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	BBOX1	O75936	387 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TMTC4-208	ENST00000478272	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	GPSM2	P81274	684 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	SP8	Q8IXZ3	490 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	LMNB1	P20700	586 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	MPND	Q8N594	471 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	PSMD1	Q99460	953 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.62	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	GNAI3	P08754	354 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	AOC3	Q16853	763 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	PSME4	Q14997	1843 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	UFL1	O94874	794 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	FSTL1	Q12841	308 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	XDH	P47989	1333 aa		11.6	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	CHRND	Q07001	517 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
TMTC4-208	ENST00000478272	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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