RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 CSF1RP07333 972 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM161AQ3B820 660 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCN9AQ15858 1988 aa23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRM8O00222 908 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAD17O75943 681 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIMBP2O15034 1052 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 ITGA6P23229 1130 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 EPS15P42566 896 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 PASKQ96RG2 1323 aa23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 ECE2O60344 883 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 HTRA3P83110 453 aa23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP2B4P23634 1241 aa23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 FOXO4P98177 505 aa23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 MIER1Q8N108 512 aa23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 MED23Q9ULK4 1368 aa23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF609O15014 1411 aa23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 DOK7Q18PE1 504 aa23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLRG1Q96E93 195 aa23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMD14O00487 310 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 CREBZFQ9NS37 354 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 UTYO14607 1347 aa23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 G3V3G9 751 aa23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNTROBQ8N137 903 aa23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPF2Q92785 391 aa23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.83■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 MICALL2Q8IY33 904 aa23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 H7C1D1 291 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 CHRNDQ07001 517 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 PODNQ7Z5L7 613 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 JMYQ8N9B5 988 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 SUCLG2Q96I99 432 aa23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHTN1A0MZ66 631 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 KAZALD1Q96I82 304 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC10-208ENST00000469521 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 COA1Q9GZY4 146 aa23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNJ4P48050 445 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF16BQ96L93 1317 aa23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L3A6NCW0 530 aa23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L4A6NCW7 530 aa23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCNTO95613 3336 aa23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNTNAP1P78357 1384 aa23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLRK1P26718 216 aa23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.73■■□□□ 1.39
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