RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 MINPP1Q9UNW1 487 aa11□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 RASSF7Q02833 373 aa10.99□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 POLA2Q14181 598 aa10.99□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.99□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 RTKN2Q8IZC4 609 aa10.99□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 SSH3Q8TE77 659 aa10.99□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 LRRC37AA6NMS7 1700 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 NFKBIEO00221 500 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 TAF5LO75529 589 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 CHRNDQ07001 517 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 MPNDQ8N594 471 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 COPRSQ9NQ92 184 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 SNED1Q8TER0 1413 aa10.98□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 C6orf229H3BNL8 230 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 EYA2O00167 538 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 HMMRO75330 724 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 UFL1O94874 794 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 GRIPAP1Q4V328 841 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 METTL24Q5JXM2 366 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD2Q9GZV1 360 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 GGA1Q9UJY5 639 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 XDHP47989 1333 aa10.97□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 SNAP23O00161 211 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 CIAO1O76071 339 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 NEFLP07196 543 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 KCNJ4P48050 445 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 AAMPQ13685 434 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 TBC1D16Q8TBP0 767 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 PSMD1Q99460 953 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 POLLQ9UGP5 575 aa10.96□□□□□ -0.65
CASQ1-202ENST00000467691 DUOX1Q9NRD9 1551 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 LTBP3Q9NS15 1303 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 RIMBP2O15034 1052 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 ATP2B4P23634 1241 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 PRELPP51888 382 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 SUPT20HQ8NEM7 779 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 FBXO3Q9UK99 471 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 LTBP1Q14766 1721 aa10.95□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 APBB1O00213 710 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 PPIP5K2O43314 1243 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 PDE8BO95263 885 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 LMNB1P20700 586 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 KLRK1P26718 216 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 IARSP41252 1262 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 TFCP2Q12800 502 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 AOC3Q16853 763 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 WASHC4Q2M389 1173 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 C9orf131Q5VYM1 1079 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 EYA3Q99504 573 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 RNF181Q9P0P0 153 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 LEMD3Q9Y2U8 911 aa10.94□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1B0GUL6 1792 aa10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 SASH1O94885 1247 aa10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 LARGE2Q8N3Y3 721 aa10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 BCL11AQ9H165 835 aa10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.92□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 UBE4AQ14139 1066 aa10.92□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 DOK7Q18PE1 504 aa10.92□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.92□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.92□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 MED23Q9ULK4 1368 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 G3V3G9 751 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 FGFR2P21802 821 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 ATP2B3Q16720 1220 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 NIM1KQ8IY84 436 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 JDP2Q8WYK2 163 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 VPS33BQ9H267 617 aa10.91□□□□□ -0.66
CASQ1-202ENST00000467691 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms