RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462122.1

TRAF3IP1-204, Transcript of TRAF3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP1, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1-204ENST00000462122 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 COG6Q9Y2V7 657 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 XDHP47989 1333 aa14.57□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CHD4Q14839 1912 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.56□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 IARSP41252 1262 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PRELPP51888 382 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GPSM2P81274 684 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 EYA3Q99504 573 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GGA1Q9UJY5 639 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SRGAP3O43295 1099 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ATP2B4P23634 1241 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CHRNDQ07001 517 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 FBXO3Q9UK99 471 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 LTBP1Q14766 1721 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 C6orf229H3BNL8 230 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PPIP5K2O43314 1243 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 UFL1O94874 794 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 YY1P25490 414 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 LARGE2Q8N3Y3 721 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 JDP2Q8WYK2 163 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 POLLQ9UGP5 575 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 LEMD3Q9Y2U8 911 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SBF1O95248 1867 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SPEF2Q9C093 1822 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAF3IP1-204ENST00000462122 WASHC4Q2M389 1173 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 COPRSQ9NQ92 184 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.52□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 EYA2O00167 538 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CIAO1O76071 339 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 AOC3Q16853 763 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.51□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 MED23Q9ULK4 1368 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 KCNJ4P48050 445 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ATP8B2P98198 1209 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CEP85Q6P2H3 762 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 NIM1KQ8IY84 436 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SSH3Q8TE77 659 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 POLA2Q14181 598 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 LRRC24Q50LG9 513 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 METTL24Q5JXM2 366 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 FZD9O00144 591 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 TAF5LO75529 589 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PDE8BO95263 885 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 UBE4AQ14139 1066 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SIL1Q9H173 461 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 COL4A5P29400 1685 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 G3V3G9 751 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 RIMBP2O15034 1052 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 HMMRO75330 724 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 EIF6P56537 245 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 GLTPD2A6NH11 291 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 AAMPQ13685 434 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CRBNQ96SW2 442 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 A0A1B0GUL6 1792 aa14.46□□□□□ -0.09
TRAF3IP1-204ENST00000462122 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ECE2O60344 883 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 PODNQ7Z5L7 613 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 COA1Q9GZY4 146 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.45□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.44□□□□□ -0.1
TRAF3IP1-204ENST00000462122 SNAP23O00161 211 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms