RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CAVIN2O95810 425 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SNRKQ9NRH2 765 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 IVLP07476 585 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SYKP43405 635 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 BRF1Q92994 677 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CEP63Q96MT8 703 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CHD1O14646 1710 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRU-204ENST00000428026 TSPOAP1O95153 1857 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 SYT1P21579 422 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 VPS18Q9P253 973 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 TRPM2O94759 1503 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 AFMP43652 599 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 HOOK3Q86VS8 718 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 C10orf67Q8IYJ2 551 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 TESK2Q96S53 571 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 C6orf229H3BNL8 230 aa16.58■□□□□ 0.25
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PTPRU-204ENST00000428026 SLC26A6Q9BXS9 759 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRU-204ENST00000428026 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 AKR1B10O60218 316 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 FLT4P35916 1363 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 IQCA1Q86XH1 822 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1W2PP64 1363 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 GTF3C6Q969F1 213 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 NBPF4Q96M43 638 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 SEC24BO95487 1268 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM47Q96LD4 638 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 PZPP20742 1482 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 F13A1P00488 732 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 EYA1Q99502 592 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MAPKBP1O60336 1514 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 HOXC9P31274 260 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TYRO3Q06418 890 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MAP3K12Q12852 859 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 RAB3GAP1Q15042 981 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CEP57Q86XR8 500 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 SYT10Q6XYQ8 523 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TNNQ9UQP3 1299 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 PTPRCP08575 1304 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CTNNA2P26232 953 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 FBF1Q8TES7 1133 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 RAB34Q9BZG1 259 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 SNX21Q969T3 373 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 16.3
PTPRU-204ENST00000428026 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 IP6K1Q92551 441 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CATIPQ7Z7H3 387 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CAPZA3Q96KX2 299 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 GOLGA1Q92805 767 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MEIS3Q99687 375 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa16.54■□□□□ 0.24
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