RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ATG3Q9NT62 314 aa28.35■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 BTAF1O14981 1849 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 TAF5LO75529 589 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 RPS6KB1P23443 525 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 HAUS7Q99871 368 aa28.34■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 TCHHQ07283 1943 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 TFCP2Q12800 502 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 CNPY2Q9Y2B0 182 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.33■■■□□ 2.13
PMS1-205ENST00000409985 TRIM37O94972 964 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 MSNP26038 577 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 TPCN1Q9ULQ1 816 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 ST3GAL1Q11201 340 aa28.32■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 GDPD2Q9HCC8 539 aa28.3■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 FOXO4P98177 505 aa28.29■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 CCDC39Q9UFE4 941 aa28.29■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.29■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 PALLDQ8WX93 1383 aa28.29■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.28■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 NBPF26B4DH59 902 aa28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 NBPF14Q5TI25 921 aa28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 NBPF15Q8N660 670 aa28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 ELP1O95163 1332 aa28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PMS1-205ENST00000409985 SPEF2Q9C093 1822 aa28.26■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.26■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.26■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.25■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 TJP1Q07157 1748 aa28.25■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 CIAO1O76071 339 aa28.25■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.24■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.24■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 FBXO3Q9UK99 471 aa28.24■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 ZNF609O15014 1411 aa28.24■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 TERF1P54274 439 aa28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 OFD1O75665 1012 aa28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 NEK1Q96PY6 1258 aa28.23■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 KRT85P78386 507 aa28.22■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 NECAB1Q8N987 351 aa28.22■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 FIBPO43427 364 aa28.21■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 KCNQ4P56696 695 aa28.21■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PMS1-205ENST00000409985 ILDR2Q71H61 639 aa28.2■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.2■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
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PMS1-205ENST00000409985 EYA2O00167 538 aa28.18■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 RNF214Q8ND24 703 aa28.18■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 GTF3C6Q969F1 213 aa28.18■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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PMS1-205ENST00000409985 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.16■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.16■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.16■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 ITPK1Q13572 414 aa28.15■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 PROM2Q8N271 834 aa28.15■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 CYP21A2P08686 494 aa28.15■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.15■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.14■■■□□ 2.1
PMS1-205ENST00000409985 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.14■■■□□ 2.1
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