RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 GGA1Q9UJY5 639 aa23■■□□□ 1.27
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PTPRN2-204ENST00000404321 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2-204ENST00000404321 EYA3Q99504 573 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2-204ENST00000404321 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRN2-204ENST00000404321 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2-204ENST00000404321 EPHX2P34913 555 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2-204ENST00000404321 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRN2-204ENST00000404321 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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PTPRN2-204ENST00000404321 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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PTPRN2-204ENST00000404321 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 HTRA3P83110 453 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTPRN2-204ENST00000404321 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 LTBP1Q14766 1721 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 ATP2B4P23634 1241 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTPRN2-204ENST00000404321 KAZALD1Q96I82 304 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 PSMD14O00487 310 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRN2-204ENST00000404321 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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PTPRN2-204ENST00000404321 CEP350Q5VT06 3117 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN2-204ENST00000404321 SHTN1A0MZ66 631 aa22.89■■□□□ 1.26
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PTPRN2-204ENST00000404321 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRN2-204ENST00000404321 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRN2-204ENST00000404321 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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PTPRN2-204ENST00000404321 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.81■■□□□ 1.24
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PTPRN2-204ENST00000404321 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
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