RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 DBNDD1Q9H9R9 158 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 GGA1Q9UJY5 639 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC11AQ9Y240 323 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH1L1O75891 902 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 CSF1RP07333 972 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 EPS15P42566 896 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.66■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 XDHP47989 1333 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 GRM8O00222 908 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGA6P23229 1130 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 TNIP1Q15025 636 aa25.65■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPRCP08575 1304 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 ECE2O60344 883 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 DOK7Q18PE1 504 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.64■■□□□ 1.7
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXO4P98177 505 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.63■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP2B4P23634 1241 aa25.62■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.62■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.62■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.62■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.61■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 SCN9AQ15858 1988 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 G3V3G9 751 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMD14O00487 310 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNQ5Q9NR82 932 aa25.59■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 PASKQ96RG2 1323 aa25.58■■□□□ 1.69
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP350Q5VT06 3117 aa25.57■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CNTROBQ8N137 903 aa25.57■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SUCLG2Q96I99 432 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SHTN1A0MZ66 631 aa25.55■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 KLRG1Q96E93 195 aa25.55■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.55■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 UTYO14607 1347 aa25.55■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 MED23Q9ULK4 1368 aa25.55■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PSME4Q14997 1843 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.54■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 MICALL2Q8IY33 904 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.54■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CHRNDQ07001 517 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 DPF2Q92785 391 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 KAZALD1Q96I82 304 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1B0GUL6 1792 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 H7C1D1 291 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CREBZFQ9NS37 354 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.52■■□□□ 1.68
ANKRD39-201ENST00000393537 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.51■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNJ4P48050 445 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 PODNQ7Z5L7 613 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.5■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 KLRK1P26718 216 aa25.49■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 USP44Q9H0E7 712 aa25.49■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF5LO75529 589 aa25.48■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.48■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.48■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L3A6NCW0 530 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L4A6NCW7 530 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 COA1Q9GZY4 146 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.47■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 SNAP23O00161 211 aa25.46■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms