RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000386307.1

SNORD12C-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 12C, humanhuman

BASIC

Gene SNORD12C, Length 89 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD12C-201ENST00000386307 COL26A1Q96A83 441 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 IFT43Q96FT9 208 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 C11orf16Q9NQ32 467 aa3.27□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TM4SF5O14894 197 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TARSP26639 723 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 CFPP27918 469 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 PREPP48147 710 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 EML3Q32P44 896 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 ANKRD34AQ69YU3 496 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TMEM40Q8WWA1 233 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM168AQ92567 244 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM84AQ96KN4 292 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 CSRNP1Q96S65 589 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 LMCD1Q9NZU5 365 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 NOD1Q9Y239 953 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 PPME1Q9Y570 386 aa3.26□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 LINC01387J3KSC0 135 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 J3QW42 95 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 SASH3O75995 380 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 GHRHP01286 108 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 INPP5BP32019 993 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 SIK1P57059 783 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 DUOXA2Q1HG44 320 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF792Q3KQV3 632 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 FBXL6Q8N531 539 aa3.25□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 CYP26A1O43174 497 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 RAP1GAPP47736 663 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 IRF5Q13568 498 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 PLCL1Q15111 1095 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 STAG2Q8N3U4 1231 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 UBASH3BQ8TF42 649 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 RBSNQ9H1K0 784 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 BCS1LQ9Y276 419 aa3.24□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 GAS2O43903 313 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 ADAM11O75078 769 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 IDH3AP50213 366 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 RTN1Q16799 776 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 KLHL23Q8NBE8 558 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 SNRKQ9NRH2 765 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa3.23□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 M0R2N6 131 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 PIK3CDO00329 1044 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TSPAN15O95858 294 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 PSAPP07602 524 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 SOX18P35713 384 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 ARSDP51689 593 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 SGO2Q562F6 1265 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 FDX2Q6P4F2 183 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 TXNDC11Q6PKC3 985 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 WFDC3Q8IUB2 231 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 SHISA5Q8N114 240 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 GLIS3Q8NEA6 775 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 NGLY1Q96IV0 654 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 CARD10Q9BWT7 1032 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 RNF208Q9H0X6 261 aa3.22□□□□□ -1.89
SNORD12C-201ENST00000386307 FSCN2O14926 492 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 C21orf2O43822 256 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 VAC14Q08AM6 782 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 ECM1Q16610 540 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 TPCN2Q8NHX9 752 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 PPP1R16BQ96T49 567 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 ADAM19Q9H013 955 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 SLC5A6Q9Y289 635 aa3.21□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 LRRC10BA6NIK2 292 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 EGFRP00533 1210 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 INHBBP09529 407 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 RXRBP28702 533 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 CDC27P30260 824 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 SOX11P35716 441 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 CTSWP56202 376 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 NCOA4Q13772 614 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 FAM117BQ6P1L5 589 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 DBX2Q6ZNG2 339 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 ZAR1Q86SH2 424 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 RUSC1Q9BVN2 902 aa3.2□□□□□ -1.9
SNORD12C-201ENST00000386307 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms