RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCER2I3L3R5 266 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAD17O75943 681 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 C6orf229H3BNL8 230 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLFN5Q08AF3 891 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNIP1Q15025 636 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNTROBQ8N137 903 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 EYA3Q99504 573 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 XDHP47989 1333 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 ECE2O60344 883 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNTNAP1P78357 1384 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 SHTN1A0MZ66 631 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 E9PSI1 815 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 PSMD14O00487 310 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 RIMBP2O15034 1052 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 UFL1O94874 794 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 FOXO4P98177 505 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 DPF2Q92785 391 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 GGA1Q9UJY5 639 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM161AQ3B820 660 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 MED23Q9ULK4 1368 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 DOK7Q18PE1 504 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 ITGA6P23229 1130 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP2B4P23634 1241 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 ALDH1L1O75891 902 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 UTYO14607 1347 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 GRM8O00222 908 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 EGFRP00533 1210 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 MICALL2Q8IY33 904 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 KAZALD1Q96I82 304 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 GMLQ99445 158 aa22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 RASSF10A6NK89 507 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRAF5O00463 557 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 CST9Q5W186 159 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPRCP08575 1304 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 PODNQ7Z5L7 613 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 KLRK1P26718 216 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 H7C1D1 291 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 VEGFBP49765 207 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHRNDQ07001 517 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 SUCLG2Q96I99 432 aa22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 DACT2Q5SW24 774 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.79■■□□□ 1.24
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