RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 RABEP1Q15276 862 aa22.28■■□□□ 1.16
SNX11-201ENST00000359238 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNX11-201ENST00000359238 SUSD4Q5VX71 490 aa22.27■■□□□ 1.16
SNX11-201ENST00000359238 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.27■■□□□ 1.16
SNX11-201ENST00000359238 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.27■■□□□ 1.16
SNX11-201ENST00000359238 EYA2O00167 538 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 CSF1RP07333 972 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 GPATCH3Q96I76 525 aa22.26■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 GNPATO15228 680 aa22.25■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 PTH1RQ03431 593 aa22.25■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.25■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.25■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.25■■□□□ 1.15
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SNX11-201ENST00000359238 DMTNQ08495 405 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 COL4A1P02462 1669 aa22.24■■□□□ 1.15
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SNX11-201ENST00000359238 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 EVI5LQ96CN4 794 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.24■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 A0A0D9SFI3 127 aa22.23■■□□□ 1.15
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SNX11-201ENST00000359238 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.23■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 ZNF609O15014 1411 aa22.22■■□□□ 1.15
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SNX11-201ENST00000359238 ADORA1P30542 326 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 CTSWP56202 376 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 RASEFQ8IZ41 740 aa22.22■■□□□ 1.15
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SNX11-201ENST00000359238 A0A1B0GUL7 405 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 ATP5JP18859 108 aa22.22■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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SNX11-201ENST00000359238 RAD50Q92878 1312 aa22.21■■□□□ 1.15
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SNX11-201ENST00000359238 LY75O60449 1722 aa22.2■■□□□ 1.15
SNX11-201ENST00000359238 BCORQ6W2J9 1755 aa22.2■■□□□ 1.14
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SNX11-201ENST00000359238 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 TAF1P21675 1872 aa22.2■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 HSPA4P34932 840 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.19■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 CIAO1O76071 339 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 NEK4P51957 841 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 PDE8AO60658 829 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 PKP1Q13835 747 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 PARP10Q53GL7 1025 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SPEF2Q9C093 1822 aa22.18■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SNAP23O00161 211 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 NTSR2O95665 410 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ARID3AQ99856 593 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 CPA1P15085 419 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.17■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 CASZ1Q86V15 1759 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 SCARF1Q14162 830 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 AK7Q96M32 723 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 HAUS7Q99871 368 aa22.16■■□□□ 1.14
SNX11-201ENST00000359238 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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