RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITSN1Q15811 1721 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RNF40O75150 1001 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF394Q53GI3 561 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMC4Q7Z404 712 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.25□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR182O15218 404 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HMOX1P09601 288 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SORBS3O60504 671 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTHP32929 405 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GMLQ99445 158 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.24□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF76P36508 570 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DAB2P98082 770 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EHHADHQ08426 723 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GCP02774 474 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPME1Q9Y570 386 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCCP43146 1447 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHLPP1O60346 1717 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.23□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APAF1O14727 1248 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEFMP07197 916 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPR3P17342 541 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTK2Q05397 1052 aa8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBL2Q08999 1139 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHRNA2Q15822 529 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF592Q92610 1267 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.21□□□□□ -1.09
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSH2Q76I76 1423 aa8.21□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.21□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AKAP12Q02952 1782 aa8.21□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.21□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPROQ16827 1216 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MARVELD3Q96A59 401 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FZD6O60353 706 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSMD2Q13200 908 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE3BQ13370 1112 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPRNQ16849 979 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SULT6B1Q6IMI4 303 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POTEAQ6S8J7 498 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.2□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRP6O75581 1613 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTSHP09668 335 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HOXC9P31274 260 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRKAR2BP31323 418 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADAMTS2O95450 1211 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL13P35225 146 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNB2Q92953 911 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARMC5Q96C12 935 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RUNDC1Q96C34 613 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.19□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NDUFB5O43674 189 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM13AO94988 1023 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARNO95453 639 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q3C1V9 767 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 USP31Q70CQ4 1352 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FLT4P35916 1363 aa8.18□□□□□ -1.1
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.18□□□□□ -1.1
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