RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa33.42■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 VPS33BQ9H267 617 aa33.41■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 PODXL2Q9NZ53 605 aa33.41■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 GPSM2P81274 684 aa33.4■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 SLC51AQ86UW1 340 aa33.4■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD2Q9GZV1 360 aa33.4■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 CNNM1Q9NRU3 951 aa33.39■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa33.38■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 XDHP47989 1333 aa33.38■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 SRGAP3O43295 1099 aa33.37■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 C9orf131Q5VYM1 1079 aa33.37■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 ATP8B2P98198 1209 aa33.36■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 RNF181Q9P0P0 153 aa33.36■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 ATP2B4P23634 1241 aa33.35■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 GGA1Q9UJY5 639 aa33.35■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO3Q9UK99 471 aa33.35■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 C6orf229H3BNL8 230 aa33.34■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 IARSP41252 1262 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 CHRNDQ07001 517 aa33.34■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 EYA3Q99504 573 aa33.34■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf115Q9H7X2 142 aa33.34■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 POLLQ9UGP5 575 aa33.34■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 LTBP1Q14766 1721 aa33.34■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 PRELPP51888 382 aa33.33■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D16Q8TBP0 767 aa33.33■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 LEMD3Q9Y2U8 911 aa33.33■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa33.33■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 KLHDC4Q8TBB5 520 aa33.32■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 COPRSQ9NQ92 184 aa33.32■■■□□ 2.93
CRIP1-201ENST00000330233 MROH5Q6ZUA9 1318 aa33.32■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 EYA2O00167 538 aa33.3■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 UFL1O94874 794 aa33.3■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 WASHC4Q2M389 1173 aa33.3■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa33.29■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 LARGE2Q8N3Y3 721 aa33.29■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 JDP2Q8WYK2 163 aa33.29■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 DUOX1Q9NRD9 1551 aa33.29■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 PPIP5K2O43314 1243 aa33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 CIAO1O76071 339 aa33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA2012Q0VF49 1180 aa33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC24Q50LG9 513 aa33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 SSH3Q8TE77 659 aa33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 POLA2Q14181 598 aa33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 CEP85Q6P2H3 762 aa33.28■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1B0GUL6 1792 aa33.27■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 KCNJ4P48050 445 aa33.27■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 AOC3Q16853 763 aa33.27■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF804BA4D1E1 1349 aa33.26■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 TAF5LO75529 589 aa33.26■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 METTL24Q5JXM2 366 aa33.26■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 SIL1Q9H173 461 aa33.26■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 YY1P25490 414 aa33.25■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 IL15P40933 162 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 ATG9AQ7Z3C6 839 aa33.24■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 NIM1KQ8IY84 436 aa33.24■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 CRBNQ96SW2 442 aa33.24■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 RIMBP2O15034 1052 aa33.23■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 TIAM2Q8IVF5 1701 aa33.22■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 HMMRO75330 724 aa33.22■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 PDE8BO95263 885 aa33.22■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP33.22■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 AAMPQ13685 434 aa33.22■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 UBE4AQ14139 1066 aa33.22■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 CEP126Q9P2H0 1117 aa33.22■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 G3V3G9 751 aa33.21■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF8Q5TAQ9 597 aa33.21■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 MED23Q9ULK4 1368 aa33.2■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 FZD9O00144 591 aa33.2■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 DPY19L2Q6NUT2 758 aa33.2■■■□□ 2.91
CRIP1-201ENST00000330233 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 VGLL2Q8N8G2 317 aa33.19■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 ZNRF3Q9ULT6 936 aa33.19■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 SURF6O75683 361 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 EIF6P56537 245 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 SNAP23O00161 211 aa33.15■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 SIRT2Q8IXJ6 389 aa33.15■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 COL4A5P29400 1685 aa33.14■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 DOK7Q18PE1 504 aa33.14■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 COA1Q9GZY4 146 aa33.14■■■□□ 2.9
CRIP1-201ENST00000330233 GLTPD2A6NH11 291 aa33.13■■■□□ 2.89
CRIP1-201ENST00000330233 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa33.13■■■□□ 2.89
CRIP1-201ENST00000330233 TXNRD3Q86VQ6 643 aa33.13■■■□□ 2.89
CRIP1-201ENST00000330233 DBNDD1Q9H9R9 158 aa33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms