RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 SAMD7Q7Z3H4 446 aa32.3■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 SAPCD2Q86UD0 394 aa32.3■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 DPF2Q92785 391 aa32.3■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa32.3■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 G3V3G9 751 aa32.29■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 AOC2O75106 756 aa32.29■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 DCAF8Q5TAQ9 597 aa32.29■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 CHMP4AQ9BY43 222 aa32.29■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNQ5Q9NR82 932 aa32.29■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 SCN9AQ15858 1988 aa32.28■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 PDE8AO60658 829 aa32.28■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 UFL1O94874 794 aa32.28■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 USP48Q86UV5 1035 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 TSPYL6Q8N831 410 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 RTL9Q8NET4 1388 aa32.27■■■□□ 2.76
PPP4R4-202ENST00000328839 RPS12P25398 132 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 GGA1Q9UJY5 639 aa32.26■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa32.26■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 SPEF2Q9C093 1822 aa32.26■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 PODXL2Q9NZ53 605 aa32.25■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 MYH3P11055 1940 aa32.25■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 EGFRP00533 1210 aa32.24■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 MAP2K2P36507 400 aa32.24■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 STK31Q9BXU1 1019 aa32.23■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 DLK2Q6UY11 383 aa32.22■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa32.22■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 HHIPL1Q96JK4 782 aa32.22■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 TSKSQ9UJT2 592 aa32.22■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC184Q52MB2 194 aa32.21■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT26Q7Z3Y9 468 aa32.21■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 PI4KAP2A4QPH2 592 aa32.2■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 KSR2Q6VAB6 950 aa32.2■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa32.2■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 PSME4Q14997 1843 aa32.2■■■□□ 2.75
PPP4R4-202ENST00000328839 NEXNQ0ZGT2 675 aa32.19■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa32.19■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 VIL1P09327 827 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 HUNKP57058 714 aa32.18■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 XDHP47989 1333 aa32.18■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 ADM5C9JUS6 153 aa32.17■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 IGKV5-2P06315 115 aa32.17■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 CTSWP56202 376 aa32.17■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 WWC1Q8IX03 1113 aa32.14■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 ABHD8Q96I13 439 aa32.14■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 GGA3Q9NZ52 723 aa32.14■■■□□ 2.74
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP2B4P23634 1241 aa32.13■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC27Q2M243 656 aa32.13■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 CA12O43570 354 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 G2E3Q7L622 706 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 SULF1Q8IWU6 871 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 C2orf69Q8N8R5 385 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 TTLL11Q8NHH1 800 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 GREM2Q9H772 168 aa32.12■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC4A2P04920 1241 aa32.11■■■□□ 2.73
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PPP4R4-202ENST00000328839 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa32.1■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 NEURL1BA8MQ27 555 aa32.1■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa32.1■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 AGBL3Q8NEM8 1001 aa32.1■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 RGMBQ6NW40 437 aa32.08■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 ZIC5Q96T25 663 aa32.08■■■□□ 2.73
PPP4R4-202ENST00000328839 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
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PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L3A6NCW0 530 aa32.07■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L4A6NCW7 530 aa32.07■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L1Q7RTZ2 530 aa32.07■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 MINPP1Q9UNW1 487 aa32.07■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF609O15014 1411 aa32.07■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 SCARF1Q14162 830 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 PODNQ7Z5L7 613 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 MRS2Q9HD23 443 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 MED23Q9ULK4 1368 aa32.06■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 IL16Q14005 1332 aa32.05■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 USP17L8P0C7I0 530 aa32.05■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 FBXW7Q969H0 707 aa32.05■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 FLIIQ13045 1269 aa32.04■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 CDCA5Q96FF9 252 aa32.04■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 MYOZ2Q9NPC6 264 aa32.04■■■□□ 2.72
PPP4R4-202ENST00000328839 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
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