RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA1P04083 346 aa27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 SPAG5Q96R06 1193 aa27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 SELENOOQ9BVL4 669 aa27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 PPM1EQ8WY54 764 aa27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 IKBKGQ9Y6K9 419 aa27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.54■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 TACC1O75410 805 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP8B2P98198 1209 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX12PQ92771 950 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGS1P23219 599 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 HS1BP3Q53T59 392 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 SMC5Q8IY18 1101 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.53■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 PIP4K2BP78356 416 aa27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 TMTC2Q8N394 836 aa27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 RASAL2Q9UJF2 1139 aa27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMM50Q9Y512 469 aa27.52■■■□□ 2
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 FBF1Q8TES7 1133 aa27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 PLVAPQ9BX97 442 aa27.51■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMA7O14818 248 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 SPTLC2O15270 562 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC174Q6PII3 467 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ATRIPQ8WXE1 791 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ERMNQ8TAM6 284 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXO3O43524 673 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ACTN2P35609 894 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT83P78385 493 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.5■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX58Q96C10 678 aa27.49■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ESR2Q92731 530 aa27.49■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF4AO95239 1232 aa27.49■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN2P17655 700 aa27.49■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.49■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 AK2P54819 239 aa27.48■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 MSL1Q68DK7 614 aa27.48■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 TSNARE1Q96NA8 513 aa27.48■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf229H3BNL8 230 aa27.48■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 HLA-DOAP06340 250 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPY3P0CV98 308 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPY8P0CW00 308 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRL1O94910 1474 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ASIC1P78348 528 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 BICD1Q96G01 975 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 STX8Q9UNK0 236 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.47■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT86O43790 486 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 FERMT1Q9BQL6 677 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 CABP5Q9NP86 173 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS18Q9P253 973 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 FERP16591 822 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP7A1P22680 504 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTO1P78417 241 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPZA3Q96KX2 299 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 COMMD10Q9Y6G5 202 aa27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF5AQ12840 1032 aa27.45■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.45■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPHP41219 470 aa27.45■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 IDI1Q13907 227 aa27.45■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 SYT10Q6XYQ8 523 aa27.45■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 FEZ1Q99689 392 aa27.45■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 MICALL1Q8N3F8 863 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH1L1O75891 902 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT13P13646 458 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC6Q16204 474 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 ACEP12821 1306 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 FBLN1P23142 703 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 IFNKQ9P0W0 207 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA24Q86W54 205 aa27.44■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR78Q5VTH9 848 aa27.43■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 LZTFL1Q9NQ48 299 aa27.43■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.43■■□□□ 1.98
GNPTAB-201ENST00000299314 GRM8O00222 908 aa27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms