RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 SYT1P21579 422 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 SIK1P57059 783 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 ATP2B3Q16720 1220 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 FOSBP53539 338 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 FERMT3Q86UX7 667 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 A0A0G2JLW4 131 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 COL15A1P39059 1388 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TOM1O60784 492 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 ZAP70P43403 619 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CTSWP56202 376 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 GPT2Q8TD30 523 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 MED23Q9ULK4 1368 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 STX6O43752 255 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 HAND2P61296 217 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CHST3Q7LGC8 479 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 FIBPO43427 364 aa20.09■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 FSD2A1L4K1 749 aa20.09■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CYP21A2P08686 494 aa20.09■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 MRE11P49959 708 aa20.09■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 NEK1Q96PY6 1258 aa20.09■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.09■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.09■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CIAO1O76071 339 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 RPS6KB1P23443 525 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 ITPK1Q13572 414 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN3-201ENST00000291906 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 DISP2A7MBM2 1401 aa20.08■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 SUSD4Q5VX71 490 aa20.08■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 GPR108Q9NPR9 543 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 Q6ZUG5 572 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 IL17RAQ96F46 866 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 DDX11Q96FC9 970 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 PDE8AO60658 829 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 CSF1RP07333 972 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 BRF1Q92994 677 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 USP48Q86UV5 1035 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 SYCE3A1L190 88 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 M0R2C6 588 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 OSBP2Q969R2 916 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 ITGB4P16144 1822 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 MAST3O60307 1309 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 ST3GAL1Q11201 340 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 APPP05067 770 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 KCNB2Q92953 911 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 KRT32Q14532 448 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 PALLDQ8WX93 1383 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 PHKA1P46020 1223 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 ANKRD1Q15327 319 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 RNF214Q8ND24 703 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 JAK2O60674 1132 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 F13A1P00488 732 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.02■□□□□ 0.8
PKN3-201ENST00000291906 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms