RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283206.8

TMEM87B-201, Transcript of transmembrane protein 87B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TMEM87B, Length 5,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87B-201ENST00000283206 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 MAPKBP1O60336 1514 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 CBX1P83916 185 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 Q6ZUG5 572 aa16.03■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 KRT24Q2M2I5 525 aa16.02■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.02■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.02■□□□□ 0.16
TMEM87B-201ENST00000283206 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.02■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 RMND1Q9NWS8 449 aa16.02■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa16.02■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.02■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 N4BP3O15049 544 aa16.02■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ZFYVE9O95405 1425 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 USP8P40818 1118 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ERMNQ8TAM6 284 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TRIM47Q96LD4 638 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 NYXQ9GZU5 481 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 RLBP1P12271 317 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 PIK3C2GO75747 1445 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 OGFOD1Q8N543 542 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 A0A1W2PP64 1363 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 PRC1O43663 620 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 KCNA6P17658 529 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TNNQ9UQP3 1299 aa16.01■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 C8orf37Q96NL8 207 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 EXOC1Q9NV70 894 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 F8W031 263 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 IP6K1Q92551 441 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ABCC1P33527 1531 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 GNAT2P19087 354 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 SNX21Q969T3 373 aa16■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 HOXC9P31274 260 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CNPY2Q9Y2B0 182 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TBX22Q9Y458 520 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TMCO5BA8MYB1 307 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 SMC5Q8IY18 1101 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TRPM2O94759 1503 aa15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 STAT6P42226 847 aa15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 AFMP43652 599 aa15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 AKR1B10O60218 316 aa15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 F13A1P00488 732 aa15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 NOP2P46087 812 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 RRAGBQ5VZM2 374 aa15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 SPAG1Q07617 926 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 USP48Q86UV5 1035 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CALM1P0DP23 149 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CALM2P0DP24 149 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CALM3P0DP25 149 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 HOOK3Q86VS8 718 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 DACT1Q9NYF0 836 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 UBASH3AP57075 661 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 PICALMQ13492 652 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CCDC174Q6PII3 467 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TRIM75PA6NK02 468 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CTNNA2P26232 953 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TFCP2Q12800 502 aa15.97■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 PLCG2P16885 1265 aa15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 NAPAP54920 295 aa15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TMX1Q9H3N1 280 aa15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 ZMYM3Q14202 1370 aa15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 CALML3P27482 149 aa15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TMEM87B-201ENST00000283206 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms