RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf111Q8N326 155 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A40Q8TBP6 338 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MCHR2Q969V1 340 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52B2Q96RD2 323 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 NPTNQ9Y639 398 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CHP2O43745 196 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHMP01871 453 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 STOMP27105 288 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 NRN1LQ496H8 165 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF613Q6PF04 617 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF101Q8IZC7 436 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SMYD1Q8NB12 490 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT14Q8NB59 555 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 NOXO1Q8NFA2 376 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 EVA1AQ9H8M9 152 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 NPHS2Q9NP85 383 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CYSLTR2Q9NS75 346 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf49A4QMS7 147 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIBP23284 216 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 GDI2P50395 445 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 STX1BP61266 288 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 LEG1Q6P5S2 330 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MSRB3Q8IXL7 192 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL36Q8N4N3 616 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SPICQ8N5J4 248 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2J1Q9GZK6 312 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF16Q9NXF7 216 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 EGFL7Q9UHF1 273 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SNNO75324 88 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MDKP21741 143 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 PCGF2P35227 344 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT5AP41221 380 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLITRK2Q9H156 845 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF229Q9UJW7 825 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGPT4Q9Y264 503 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRG6 482 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC2LH3BP13 241 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 GPANK1O95872 356 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV2-70P01814 119 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF12P17014 697 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC9A3R2Q15599 337 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMAT1Q5H9K5 638 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM255AQ5JRV8 349 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00114Q6XXX2 140 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATC1Q76KD6 591 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MAVSQ7Z434 540 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR7LQ8NHP1 331 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD4Q8TB40 342 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DIRC2Q96SL1 478 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MSL2Q9HCI7 577 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLAMF8Q9P0V8 285 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 INSIG2Q9Y5U4 225 aa23.1■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 FMO6PO60774 539 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CDAP32320 146 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 LIPAP38571 399 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MTNR1AP48039 350 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TUSC1Q2TAM9 212 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRNQ5BIV9 151 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTPD8Q5MY95 495 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 LRIF1Q5T3J3 769 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 POM121L2Q96KW2 1035 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC19A3Q9BZV2 496 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM38AQ9H6F2 299 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SIAEQ9HAT2 523 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A7Q9UM01 511 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 OPN1SWP03999 348 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 F13BP05160 661 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF32P17041 273 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 OMGP23515 440 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1CBP62140 327 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SGCAQ16586 387 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 HDDC2Q7Z4H3 204 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 JAZF1Q86VZ6 243 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-217ENST00000629983 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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