RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CD5LO43866 347 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFS7O75251 213 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV4-39P01824 125 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 BGLAPP02818 100 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H2ABP04908 130 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SHC1P29353 583 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ACVR1BP36896 505 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN1AP38936 164 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 RAC1P63000 192 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ETFDHQ16134 617 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 NXNL2Q5VZ03 156 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H2ACQ93077 130 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 TAAR8Q969N4 342 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCA4Q9BXL8 241 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf49Q9H741 205 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF115Q9Y4L5 304 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV27A0A087WT01 109 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PCMT1P22061 227 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL22Q53GT1 634 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf140Q5VVS0 124 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 XAF1Q6GPH4 301 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TFAP2EQ6VUC0 442 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKK1Q8NFD2 765 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD8Q8NHS3 518 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 FCGR1BQ92637 280 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PTDSS2Q9BVG9 487 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM185BQ9H7F4 350 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CORINQ9Y5Q5 1042 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 EFNA2O43921 213 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNDC12O95881 172 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 IFNGP01579 166 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CD8AP01732 235 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 PTNP21246 168 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TAB1Q15750 504 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SATL1Q86VE3 508 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC17Q8N6Y2 441 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC75AQ8NAA5 344 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 STEAP2Q8NFT2 490 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF128Q8TEB7 428 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW5Q969U6 566 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DDIT4LQ96D03 193 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ALPK2Q86TB3 2170 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A096LNT2 108 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R129 80 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 AHSA1O95433 338 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 IDUAP35475 653 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ST3GAL4Q11206 333 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF3Q14653 427 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC4Q5T2S8 1044 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 AHSA2Q719I0 299 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GID4Q8IVV7 300 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD3Q8WU67 409 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ROBO4Q8WZ75 1007 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SGCDQ92629 289 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MOGAT1Q96PD6 335 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SRXN1Q9BYN0 137 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RIIAD1A6NNX1 92 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNGR4O95473 234 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 CD14P08571 375 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB40BQ12829 278 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SFRP5Q5T4F7 317 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 HBMQ6B0K9 141 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ALKBH2Q6NS38 261 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR141Q7Z602 305 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 STX19Q8N4C7 294 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf53Q8N6V4 93 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAIQ8N9R8 606 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 AMBNQ9NP70 447 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 DPRXA6NFQ7 191 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 FTCDNL1E5RQL4 147 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC14L2O76054 403 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 MT-ND2P03891 347 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 HTR1FP30939 366 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS5P46782 204 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms