RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 DIRAS1O95057 198 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 NDUFB2O95178 105 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 GADD45GO95257 159 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 SNAP29O95721 258 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 LY6G6DO95868 133 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 PATE4P0C8F1 98 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 GLRXP35754 106 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 KRT80Q6KB66 452 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 HTRA1Q92743 480 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 RBP7Q96R05 134 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 REG4Q9BYZ8 158 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC3-214ENST00000601319 RNF223E7ERA6 249 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 PTP4A3O75365 173 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 PTHP01270 115 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 T-ENOLP0DO92 83 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 ATP6V1B2P21281 511 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 EVX1P49640 407 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 ERVK-25P63136 954 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 GALK2Q01415 458 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SPIBQ01892 262 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 MESTQ5EB52 335 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 FAM27BQ5VT28 67 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 GPR139Q6DWJ6 353 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 LCN8Q6JVE9 175 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 CLDN22Q8N7P3 220 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 ZNF570Q96NI8 536 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 DOK1Q99704 481 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 C1orf21Q9H246 121 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 NRIP3Q9NQ35 241 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 AURKCQ9UQB9 309 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 CMAHPQ9Y471 501 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 HIVEP2P31629 2446 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 XKRYO14609 159 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 FPR3P25089 353 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SDHAP31040 664 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 CDAP32320 146 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 MAGEA2P43356 314 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 FXYD6P3P58550 94 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 PLP2Q04941 152 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 ADCK1Q86TW2 530 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SVOPLQ8N434 492 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 ZNF525Q8N782 197 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 OR52J3Q8NH60 311 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 NSMAFQ92636 917 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 Q96M85 177 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 KCNN2Q9H2S1 579 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 RNF121Q9H920 327 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 A0A096LNT2 108 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 TMEM129A0AVI4 362 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 PRSS37A4D1T9 235 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 UNC119BA6NIH7 251 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 GPRIN2O60269 458 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 CST2P09228 141 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 APEHP13798 732 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SLC25A16P16260 332 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 RRM2P31350 389 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 THSD4Q6ZMP0 1018 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 RINLQ6ZS11 566 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 LRRC18Q8N456 261 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 FANK1Q8TC84 345 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 C10orf105Q8TEF2 133 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 FAM168AQ92567 244 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 WACQ9BTA9 647 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 TCRBV5S2A0A599 114 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 NDUFS8O00217 210 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 KRT36O76013 467 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 TXNDC12O95881 172 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC3-214ENST00000601319 ZNF32P17041 273 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms