RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM163Q8TC26 289 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.69□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 A0A1W2PQM1 296 aa5.69□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.68□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 C10orf35Q96D05 121 aa5.68□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 H7C417 338 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 DEGS1O15121 323 aa5.68□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 CD1EP15812 388 aa5.68□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 ADPRMQ3LIE5 342 aa5.68□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.68□□□□□ -1.5
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SMAD4-212ENST00000591126 OR6X1Q8NH79 312 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 MCFD2Q8NI22 146 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 FCAMRQ8WWV6 532 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-212ENST00000591126 TM4SF19Q96DZ7 209 aa5.68□□□□□ -1.5
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