RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRY3O43610 288 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TGDSO95455 350 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 F13BP05160 661 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNOP22674 350 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 APLNRP35414 380 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MPV17P39210 176 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP15P51511 669 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF84P51523 738 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 UBA52P62987 128 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 HSF2Q03933 536 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SELPLGQ14242 412 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MOGQ16653 247 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP51A1Q16850 503 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA46Q5T0L3 261 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF101Q8IZC7 436 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL17Q92583 94 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ELMOD3Q96FG2 381 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 GAL3ST1Q99999 423 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS27Q9BQR3 290 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC19A3Q9BZV2 496 aa21.76■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS23O95084 383 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CD247P20963 164 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT5AP41221 380 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MTPNP58546 118 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 LCN2P80188 198 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM209AQ5JX71 171 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB10Q8WXI3 467 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MPP4Q96JB8 637 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MCIDASD6RGH6 385 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMUO75648 421 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 UBOX5O94941 541 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A10O95528 541 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 GATA3P23771 443 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 STOMP27105 288 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CDAP32320 146 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP4BP51164 291 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2B15P54855 530 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 THEM4Q5T1C6 240 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 HDXQ7Z353 690 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 TAMM41Q96BW9 452 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIAL4AQ9Y536 164 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa21.74■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ACADSP16219 412 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf128Q5T292 105 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 DHDDSQ86SQ9 333 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 RETREG3Q86VR2 466 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NABP1Q96AH0 204 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 POM121L2Q96KW2 1035 aa21.73■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC100509620A0A075B734 347 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PRG6 482 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ISPDA4D126 451 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPBD1B2RD01 187 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MGRN1O60291 552 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF32P17041 273 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 GCH1P30793 250 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF718Q3SXZ3 478 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SPRNQ5BIV9 151 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PRR31Q5SQ13 230 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR7LQ8NHP1 331 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PFN4Q8NHR9 129 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A40Q8TBP6 338 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 SIAEQ9HAT2 523 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 UBAP1Q9NZ09 502 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 C5orf49A4QMS7 147 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP2P41181 271 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYBA2P53672 197 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 FMODQ06828 376 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 CGREF1Q99674 301 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF747Q9BV97 191 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2J1Q9GZK6 312 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNN2Q9H2S1 579 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 VIPAS39Q9H9C1 493 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 INIPQ9NRY2 104 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAM2Q2M2H8 2515 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-211ENST00000590874 PLSCR5A0PG75 271 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS2O15393 492 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7A10O76100 309 aa21.7■■□□□ 1.06
CAPNS1-211ENST00000590874 MT-ND1P03886 318 aa21.7■■□□□ 1.06
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