RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 CAMK2DQ13557 499 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 OPCMLQ14982 345 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 MEP1BQ16820 701 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 KLHL26Q53HC5 615 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A25Q6KCM7 469 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SIAH3Q8IW03 269 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 PTDSS2Q9BVG9 487 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 EPXP11678 715 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 GABRA4P48169 554 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NRG3P56975 720 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ACY1Q03154 408 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NTRK2Q16620 822 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 MDGA2Q7Z553 956 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SLC2A12Q8TD20 617 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LANCL2Q9NS86 450 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 PI4KAP42356 2102 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.64□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 H0YIG0 161 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZNF749O43361 778 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NME1P15531 152 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 GPR143P51810 404 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZNF117Q03924 483 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NHLRC3Q5JS37 347 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 FCRLAQ7L513 359 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 RAB11FIP2Q7L804 512 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 OR6V1Q8N148 313 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SEMA4CQ9C0C4 833 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NRIP3Q9NQ35 241 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 FLRT2O43155 660 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 IL11P20809 199 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 POU3F4P49335 361 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 DIO1P49895 249 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 TSPAN5P62079 268 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZSWIM7Q19AV6 140 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 BICRALQ6AI39 1079 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SYT13Q7L8C5 426 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SMIM19Q96E16 107 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 GFI1Q99684 422 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 UBQLN4Q9NRR5 601 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 GPR179Q6PRD1 2367 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZNF264O43296 627 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 TXNL1O43396 289 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 AKR7A3O95154 331 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 DCNP07585 359 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 DMWDQ09019 674 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SKP2Q13309 424 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 MELKQ14680 651 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZNF74Q16587 644 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 TMEM255AQ5JRV8 349 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LIPNQ5VXI9 398 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LINGO2Q7L985 606 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 OR1M1Q8NGA1 313 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 DMRTA2Q96SC8 542 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 PFDN5Q99471 154 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 KLK11Q9UBX7 282 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 NDRG3Q9UGV2 375 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 SERTAD3Q9UJW9 196 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LHX6Q9UPM6 363 aa13.63□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 MEIS3P1A6NDR6 274 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ANXA2P2A6NMY6 339 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 VSTM5A8MXK1 200 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 MPZL1O95297 269 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LINC01590Q5TEZ4 76 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 PXKQ7Z7A4 578 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 GKN2Q86XP6 184 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 C9orf40Q8IXQ3 194 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 CMTM4Q8IZR5 234 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ15Q99712 375 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZPBPQ9BS86 351 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 EMC7Q9NPA0 242 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 MMP25Q9NPA2 562 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ASPMQ8IZT6 3477 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 METTL12A8MUP2 240 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 OR2T7P0C7T2 308 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 CSF2RBP32927 897 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 BTCP35070 178 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 FASLGP48023 281 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 TSC22D1Q15714 1073 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 ZNF528Q3MIS6 628 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LIN54Q6MZP7 749 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 LRRN1Q6UXK5 716 aa13.62□□□□□ -0.23
CTIF-205ENST00000587860 OR2T27Q8NH04 317 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms