RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF347Q96SE7 839 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDH20Q9HBT6 801 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.17□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 24
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PRG6 482 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC14BO60729 498 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR7A10O76100 309 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC2A10O95528 541 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLPTM1O96005 669 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGHG1P01857 330 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCKP06239 509 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 C8BP07358 591 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 QDPRP09417 244 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGA4P0DJD7 388 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGA3P0DJD8 388 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF35P13682 527 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GIFP27352 417 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDAP32320 146 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 AQP2P41181 271 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPA13P48723 471 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GZMMP51124 257 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R41P59536 307 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FXNQ16595 210 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 REP15Q6BDI9 236 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF627Q7L945 461 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MICU2Q8IYU8 434 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF786Q8N393 782 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC18Q8N456 261 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR6X1Q8NH79 312 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NSMAFQ92636 917 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPD52L3Q96J77 140 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MPP4Q96JB8 637 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDRT15Q96T59 188 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 NANOGQ9H9S0 305 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 TREM2Q9NZC2 230 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB26Q9ULW5 256 aa6.16□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 WNT9BO14905 357 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MT-ND1P03886 318 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SERPINA5P05154 406 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCNOP22674 350 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL8A2P25067 703 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSTT1P30711 240 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLRXP35754 106 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEB1P43366 347 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF84P51523 738 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDH15P55291 814 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSME3P61289 254 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL8P80075 99 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSF2Q03933 536 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD47Q08722 323 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZP4Q12836 540 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIN1Q13671 783 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGCAQ16586 387 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNPY1Q3B7I2 92 aa6.15□□□□□ -1.42
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms