RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF160Q9HCG1 818 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.11□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LIPT2A6NK58 231 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 YKT6O15498 198 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC19A2O60779 497 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERPINA3P01011 423 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM157BP0CG42 384 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCL3P10147 92 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPR2P20594 1047 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MPLP40238 635 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ADAM8P78325 824 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSF2Q03933 536 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TLE3Q04726 772 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NTRK2Q16620 822 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR38Q5JTN6 314 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MISPQ8IVT2 679 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2M3Q8NG83 312 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASB10Q8WXI3 467 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RNF170Q96K19 258 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFP3Q96NJ6 502 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LNP1A1A4G5 178 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 M0R296 226 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HLA-DQB1P01920 261 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD3GP09693 182 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 INPP1P49441 399 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DGCR2P98153 550 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRT74Q7RTS7 529 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TTC9Q92623 222 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GNRHR2Q96P88 292 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNK15Q9H427 330 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FKBP7Q9Y680 259 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 FRYQ5TBA9 3013 aa9.1□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2T1O43869 369 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC43A1O75387 559 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARL6IP5O75915 188 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAS1P04201 325 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYPP08247 313 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 SP9P0CG40 484 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PITPNBP48739 271 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 BIDP55957 195 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 HSF1Q00613 529 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 STK11Q15831 433 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIM63Q969Q1 353 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNJ15Q99712 375 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD6Q9BV23 337 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR54Q9H977 334 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PROK2Q9HC23 129 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHST11Q9NPF2 352 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MCUBQ9NWR8 336 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPRIN2O60269 458 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GATBO75879 557 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 F10P00742 488 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 TACSTD2P09758 323 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MFAP5Q13361 173 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 RIN1Q13671 783 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPR176Q14439 515 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 YIF1BQ5BJH7 314 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 GPAT4Q86UL3 456 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF676Q8N7Q3 588 aa9.09□□□□□ -0.95
CCNDBP1-210ENST00000566882 MFSD8Q8NHS3 518 aa9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms