RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.13□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ZNF175Q9Y473 711 aa7.13□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.13□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 LAMA5O15230 3695 aa7.13□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 MED12LQ86YW9 2145 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 DOCK7Q96N67 2140 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 OR6C68A6NDL8 312 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 A6NIZ1 184 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 SLC22A20A6NK97 555 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 FAM183AA6NL82 134 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 AHRRA9YTQ3 701 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 H7C1C5 153 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ARHGEF9O43307 516 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ENTPD6O75354 484 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 TGM6O95932 706 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 BCL10O95999 233 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 IFNGP01579 166 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 FMO3P31513 532 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ACVR1BP36896 505 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CLDN17P56750 224 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 RAP1BP61224 184 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 LCN6P62502 163 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 RAP1AP62834 184 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ITGADQ13349 1161 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 C1DQ13901 141 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 C6orf141Q5SZD1 244 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 FAM205BPQ63HN1 556 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 LEG1Q6P5S2 330 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ADCK1Q86TW2 530 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CPOQ8IVL8 374 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 BBS1Q8NFJ9 593 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 OR6X1Q8NH79 312 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PTP4A1Q93096 173 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ZNF503Q96F45 646 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 LRR1Q96L50 414 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 SNX18Q96RF0 628 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 EMC6Q9BV81 110 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 MED20Q9H944 212 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CLN6Q9NWW5 311 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.12□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 BSNQ9UPA5 3926 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PRSS37A4D1T9 235 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CCDC182A6NF36 153 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ZNF724A8MTY0 619 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 SLC1A7O00341 560 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 DCTN6O00399 190 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 XKRYO14609 159 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PRODHO43272 600 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 WDR1O75083 606 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ZNF432O94892 652 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 RENP00797 406 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 TPOP07202 933 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PGA4P0DJD7 388 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PGA3P0DJD8 388 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CLUP10909 449 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 FCGR2AP12318 317 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 SLC2A5P22732 501 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 ACVR2AP27037 513 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CHN2P52757 468 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 SLC25A1P53007 311 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 NUDT6P53370 316 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CXCR4P61073 352 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CAMK2DQ13557 499 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 CD276Q5ZPR3 534 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 RTL6Q6ICC9 239 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 NIPAL3Q6P499 406 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 GFRALQ6UXV0 394 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.11□□□□□ -1.27
BEST3-211ENST00000552295 TUSC5Q8IXB3 177 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms