RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TBPL1P62380 186 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LCN6P62502 163 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 TMEM225Q6GV28 225 aa5.81□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JN53 185 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SPRED1Q7Z699 444 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PQLC3Q8N755 202 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CDRT4Q8N9R6 151 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GPR119Q8TDV5 335 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CANT1Q8WVQ1 401 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ASB13Q8WXK3 278 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ARRDC3Q96B67 414 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGDIGQ99819 225 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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