RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 WDR4P57081 412 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 ZNF74Q16587 644 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 OR2J1Q9GZK6 312 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 LRMDAQ9H2I8 198 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 IKZF5Q9H5V7 419 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 THAP1Q9NVV9 213 aa13.61□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 PLSCR5A0PG75 271 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 C5orf49A4QMS7 147 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 SNNO75324 88 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 SNAP29O95721 258 aa13.6□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 STOMP27105 288 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 ATP4BP51164 291 aa13.6□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 ZNF718Q3SXZ3 478 aa13.6□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.6□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 C1orf198Q9H425 327 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 NANSQ9NR45 359 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 TNFRSF19Q9NS68 423 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 PLEK2Q9NYT0 353 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 VAPAQ9P0L0 249 aa13.6□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 NPTNQ9Y639 398 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 LOC100509620A0A075B734 347 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 LYPD3O95274 346 aa13.59□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 IGHG1P01857 330 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 ZNF32P17041 273 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 SLC6A2P23975 617 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 ZNF84P51523 738 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 SGCAQ16586 387 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 FAM209AQ5JX71 171 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 ENTPD8Q5MY95 495 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 LINC00114Q6XXX2 140 aa13.59□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 OR4D11Q8NGI4 311 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 OR6T1Q8NGN1 323 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 ABHD4Q8TB40 342 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 NSMAFQ92636 917 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
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CS-227ENST00000551441 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 ANGPT4Q9Y264 503 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-227ENST00000551441 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 PRORSD1PA6NEY8 169 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MCIDASD6RGH6 385 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 MGRN1O60291 552 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 NGFP01138 241 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 IGHV2-70P01814 119 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 HIST1H2ABP04908 130 aa13.58□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 ERVK-25P63136 954 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 IL13RA1P78552 427 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 FMODQ06828 376 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 DUSP7Q16829 419 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 SPATC1Q76KD6 591 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 FUNDC1Q8IVP5 155 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 GPR32P1Q8NGA4 272 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 HIST1H2ACQ93077 130 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 SLC25A28Q96A46 364 aa13.58□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
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CS-227ENST00000551441 INSIG2Q9Y5U4 225 aa13.58□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 CHP2O43745 196 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ENTPD5O75356 428 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 SERPINB7O75635 380 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TRMUO75648 421 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ZNF205O95201 554 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 IGHMP01871 453 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 ZNF12P17014 697 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 SLC3A1Q07837 685 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-227ENST00000551441 LRIF1Q5T3J3 769 aa13.57□□□□□ -0.24
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