RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD49-208	ENST00000544253	UCP2	P55851	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	BID	P55957	195 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	NME5	P56597	212 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	SELENOW	P63302	87 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	PLP2	Q04941	152 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	DUSP7	Q16829	419 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253		Q8TCH9	128 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ANKRD49-208	ENST00000544253	ARID1A	O14497	2285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253		C9JVG2	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253		M0R3G1	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	IDH3B	O43837	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	PRSS23	O95084	383 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	BCL10	O95999	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SEMG1	P04279	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ADRA2A	P08913	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	KIT	P10721	976 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	CCNA2	P20248	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	GSTM3	P21266	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	GNAL	P38405	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	NFYC	Q13952	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	DGCR6	Q14129	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	YIPF5	Q969M3	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	CDH20	Q9HBT6	801 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253		M0QX08	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ADORA3	P0DMS8	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SELE	P16581	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	APLNR	P35414	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SLC7A2	P52569	658 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	CLRN1	P58418	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	GGTLC2	Q14390	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	TRAM2	Q15035	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	CBLL1	Q75N03	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	DOK3	Q7L591	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	FAM122B	Q7Z309	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	CARM1	Q86X55	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	KLB	Q86Z14	1044 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	C10orf82	Q8WW14	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKRD49-208	ENST00000544253	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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