RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RAB31Q13636 194 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TAF9Q16594 264 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PLK3Q9H4B4 646 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ACOD1A6NK06 481 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM227AF5H4B4 570 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CCSO14618 274 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CNIH1O95406 144 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINA7P05543 415 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR5AC1P0C628 307 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 DDTP30046 118 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HIST1H3AP68431 136 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 IL13RA1P78552 427 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 BAGE3Q86Y29 109 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 BAGE2Q86Y30 109 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RNF170Q96K19 258 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GPR37L1O60883 481 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINA2P20848 420 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 AHRP35869 848 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GABRA2P47869 451 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 EVX1P49640 407 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF136P52737 540 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CTSCP53634 463 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RPS21P63220 83 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MSRB3Q8IXL7 192 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NECAP1Q8NC96 275 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF480Q8WV37 535 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ASB17Q8WXJ9 295 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 APIPQ96GX9 242 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM68Q96MH6 324 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR8D2Q9GZM6 311 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 IL20RAQ9UHF4 553 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GPR160Q9UJ42 338 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CSO75390 466 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TRAPPC6AO75865 159 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SERPINA5P05154 406 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 AHCYP23526 432 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SSR2P43308 183 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 THNSL2Q86YJ6 484 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR5K2Q8NHB8 316 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GPR148Q8TDV2 347 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 INPP5KQ9BT40 448 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KCNAB3O43448 404 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NME2P1O60361 137 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SELENOFO60613 162 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CHRM2P08172 466 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TYRP1P17643 537 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PBX2P40425 430 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 BDKRB1P46663 353 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SPCS3P61009 180 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SGCGQ13326 291 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MLC1Q15049 377 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR7A5Q15622 319 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SPIN3Q5JUX0 258 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAM174AQ8TBP5 190 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SFXN5Q8TD22 340 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PDE7BQ9NP56 450 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CTDSPLO15194 276 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC3AO75596 197 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ABCD3P28288 659 aa5.56□□□□□ -1.52
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