RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 ST8SIA4Q92187 359 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 LHX9Q9NQ69 397 aa8.65□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 C17orf112F2Z3M2 114 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRB-204ENST00000538708 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 MRGPRX3Q96LB0 322 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 GALNT9Q9HCQ5 603 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRB-204ENST00000538708 HSPB11Q9Y547 144 aa8.63□□□□□ -1.03
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