RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 IFNA16P05015 189 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 GDF1P27539 372 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ATP5DP30049 168 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PPP2R1BP30154 601 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ADRA1AP35348 466 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 COILP38432 576 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ELK3P41970 407 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CCR4P51679 360 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF136P52737 540 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ATP5J2P56134 94 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RAB8AP61006 207 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KCNJ2P63252 427 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MYL5Q02045 173 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FAM53BQ14153 422 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CLEC12BQ2HXU8 276 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DEFB134Q4QY38 66 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MUC21Q5SSG8 566 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF20Q5VT98 475 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CASC4Q6P4E1 433 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM64Q6YI46 380 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RGS9BPQ6ZS82 235 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OTOAQ7RTW8 1153 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC26A11Q86WA9 606 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FBXW8Q8N3Y1 598 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 BANPQ8N9N5 519 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR7G3Q8NG95 312 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR9A1PQ8NGU1 263 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC13A3Q8WWT9 602 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FAM111AQ96PZ2 611 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PANX3Q96QZ0 392 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 BEX2Q9BXY8 128 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLITRK2Q9H156 845 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LRTM1Q9HBL6 345 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ANO10Q9NW15 660 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL28Q9NXS3 571 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 UVRAGQ9P2Y5 699 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SPRR3Q9UBC9 169 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC6A5Q9Y345 797 aa2.77□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 UQCRHLA0A096LP55 91 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 A0A0G2JN53 185 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MAGEB16A2A368 324 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF487B1APH4 448 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 E5RI56 91 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OR1F1O43749 312 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 HCN1O60741 890 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 NIPSNAP2O75323 286 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SH3BGRLO75368 114 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 EPPINO95925 133 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SLC35G6P0C7Q6 338 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 DUX4L4P0CJ87 422 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CCL3P10147 92 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RNH1P13489 461 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 EZRP15311 586 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 OPRM1P35372 400 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CDKN2BP42772 138 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 BPIFB3P59826 476 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CCZ1BP86790 482 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 SRYQ05066 204 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CUL1Q13616 776 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RCAN2Q14206 197 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 Q1RN00 199 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KLHL38Q2WGJ6 581 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ACSBG2Q5FVE4 666 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 KCTD11Q693B1 232 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 AFTPHQ6ULP2 937 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 RTL4Q6ZR62 310 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa2.76□□□□□ -1.97
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF550Q7Z398 422 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms