RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 FCRLAQ7L513 359 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR13C2Q8NGS9 318 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR5J2Q8NH18 312 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR6S1Q8NH40 331 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LIPHQ8WWY8 451 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MIB2Q96AX9 1013 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TXNDC15Q96J42 360 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SAMD8Q96LT4 415 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 OXGR1Q96P68 337 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLX1AQ9BQ83 275 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SRXN1Q9BYN0 137 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 USE1Q9NZ43 259 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL20RAQ9UHF4 553 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 POLEQ07864 2286 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.75□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 A0A0U1RQK1 487 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF320A2RRD8 509 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC22A20A6NK97 555 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF726A6NNF4 738 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 B8ZZF3 427 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 H3BN98 237 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CTDSP2O14595 271 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRRG2O14669 202 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 EI24O14681 340 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC19A2O60779 497 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 AQP8O94778 261 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SOX14O95416 240 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNAP29O95721 258 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ADAP00813 363 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGF2P01344 180 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ALPLP05186 524 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 HLA-DOBP13765 273 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SELLP14151 372 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 EPHA2P29317 976 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TTKP33981 857 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPL4P36578 427 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC9A3P48764 834 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 P2RY4P51582 365 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRPS1P60891 318 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ERVK-25P63136 954 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PMPCAQ10713 525 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZP4Q12836 540 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPRL3Q12980 569 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 C1DQ13901 141 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PON3Q15166 354 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNCBQ16143 134 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC36A3Q495N2 470 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ALG10Q5BKT4 473 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF787Q6DD87 383 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RTL6Q6ICC9 239 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MYO7BQ6PIF6 2116 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SMARCD3Q6STE5 483 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PAQR6Q6TCH4 344 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPAT4Q86UL3 456 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 MCEMP1Q8IX19 187 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF843Q8N446 348 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZIC4Q8N9L1 334 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ABHD4Q8TB40 342 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 TFAP2CQ92754 450 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa4.74□□□□□ -1.65
MSC-AS1-205ENST00000519068 SYT3Q9BQG1 590 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms