RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	NPY4R	P50391	375 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GFER	P55789	205 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FCRL6	Q6DN72	434 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR5T1	Q8NG75	326 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ARHGDIG	Q99819	225 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GLS2	Q9UI32	602 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GJE1	A6NN92	205 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CDC42EP2	O14613	210 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SCO1	O75880	301 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SERPINE2	P07093	398 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CD53	P19397	219 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GZMM	P51124	257 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PMPCA	Q10713	525 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DYRK1A	Q13627	763 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OPN5	Q6U736	354 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GRINA	Q7Z429	371 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EID2	Q8N6I1	236 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TOR1A	O14656	332 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MED6	O75586	246 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GLI4	P10075	376 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CALCB	P10092	127 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MFAP5	Q13361	173 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MLC1	Q15049	377 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MPEG1	Q2M385	716 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TMUB2	Q71RG4	321 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MIB2	Q96AX9	1013 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PMS2P2	O95744	297 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	NME2	P22392	152 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PPIC	P45877	212 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PPT1	P50897	306 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	AKR1C1	Q04828	323 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ESX1	Q8N693	406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PIGT	Q969N2	578 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLAMF9	Q96A28	289 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	HINT2	Q9BX68	163 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SMCO3	A2RU48	225 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193		E9PI62	339 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TBX19	O60806	448 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ICOSLG	O75144	302 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	F10	P00742	488 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CD3D	P04234	171 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	OMG	P23515	440 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	DPP4	P27487	766 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	CD79B	P40259	229 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	FOLR3	P41439	243 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MOB3C	Q70IA8	216 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	PELI1	Q96FA3	418 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	WDFY2	Q96P53	400 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SPIN2A	Q99865	258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	POFUT1	Q9H488	388 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP57	Q9NU63	452 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NEK1-208	ENST00000512193	MED29	Q9NX70	200 aa		7.34	□□□□□ -1.23

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