RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 MAP2K6P52564 334 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB11BQ15907 218 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ASPHD2Q6ICH7 369 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 OR7E24Q6IFN5 339 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF285Q96NJ3 590 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC61Q9BV99 259 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 FXYD6Q9H0Q3 95 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SPEGQ15772 3267 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 RORAP35398 523 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 GABRA4P48169 554 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF679Q8IYX0 411 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 PLPP7Q8NBV4 271 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC1AQ8NC01 280 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 METTL21AQ8WXB1 218 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC00052Q96N35 136 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ATG5Q9H1Y0 275 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 PLCL2Q9UPR0 1127 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CEP290O15078 2479 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 POM121CA8CG34 1229 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GALNT1O75752 331 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 BGLAPP02818 100 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CAPZBP47756 277 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TEX30Q5JUR7 227 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGAP40Q5TG30 622 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 THRSPQ92748 146 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC25A36Q96CQ1 311 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 PROS1P07225 676 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 BLKP51451 505 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 C4orf46Q504U0 113 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 STEAP1BQ6NZ63 245 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM151BQ8IW70 566 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1J4Q8NGS1 313 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SCARB1Q8WTV0 552 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 GAL3ST4Q96RP7 486 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 EXO5Q9H790 373 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SOHLH2Q9NX45 425 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CDC14CA4D256 554 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 H0YIG0 161 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 WISP1O95388 367 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 GABRA1P14867 456 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC6A8P48029 635 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TUSC1Q2TAM9 212 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 APMAPQ9HDC9 416 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 LANCL2Q9NS86 450 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MED9Q9NWA0 146 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CYP8B1Q9UNU6 501 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS37A4D1T9 235 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP3CBP16298 524 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ZP3P21754 424 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 BIKQ13323 160 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM166AQ6J272 317 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TSSK4Q6SA08 328 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 KRT77Q7Z794 578 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF128Q8TEB7 428 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ASB17Q8WXJ9 295 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 PPA2Q9H2U2 334 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC17A5Q9NRA2 495 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MED11Q9P086 117 aa24.41■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 FRG2CA6NGY1 282 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC16A7O60669 478 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT14O95848 222 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 WNT11O96014 354 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CALCRP30988 508 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 GMFBP60983 142 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ACKR1Q16570 336 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 C11orf88Q6PI97 169 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 GPX8Q8TED1 209 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ADIPOR1Q96A54 375 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR27Q9NS67 375 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 EPHA6Q9UF33 1036 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 BAMBIQ13145 260 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SHHQ15465 462 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC18B1Q6NT16 456 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 GSG1LQ6UXU4 331 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MARCH3Q86UD3 253 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 MMP17Q9ULZ9 603 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIOO75962 3097 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 OR6A2O95222 327 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 SPARCP09486 303 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 CCR5P51681 352 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 ETFDHQ16134 617 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM225Q6GV28 225 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 NAXDQ8IW45 347 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 TSLPQ969D9 159 aa24.39■■□□□ 1.5
SH3BP2-221ENST00000511747 DHDHQ9UQ10 334 aa24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms